Cid Kagenou aspire à devenir le véritable cerveau derrière tout, à tirer les ficelles et à faire en sorte que ses machinations dirigent toute l'histoire. Dans sa vie antérieure, il n'avait pas pu atteindre son objectif. Cependant, il va désormais renaître dans un monde de magie et montrer la véritable éminence de l'ombre !
Ai Ohto, une jeune fille de 14 ans, entend une voix mystérieuse l'appeler alors qu'elle se promène en ville tard la nuit. Cette voix lui donne un œuf et lui dit : "Si tu désires changer le futur, tu n'as qu'à choisir maintenant. Crois en toi et casse l'œuf."
Daï, un jeune garçon, reçoit un jour la visite d'un grand guerrier qui lui apprend les rudiments du combat à l'épée. Mais l'arrivée inopinée du Roi du Mal va bouleverser la vie du jeune homme.
Haruo Yaguchi est un élève de primaire passionné par les jeux vidéo. Un jour, la populaire Akira Ôno le bat dans une salle d'arcades à Street Fighter II. Le lendemain, décidé à ne pas revivre ça, le jeune garçon change de salle... et se retrouve à nouveau nez à nez avec Akira.
Shiroe est amateur de MMORPG. Un jour, alors qu'il joue à Elder Tales, il se retrouve piégé dans le jeu avec 30 000 autres personnes. Désormais, impossible d'utiliser le bouton de log out ou de se faire tuer. Peu à peu, les joueurs perdent la volonté de jouer, comprenant qu'ils y finiront leur vie. Mais Shiroe ne veut pas abandonner. Il débute alors un voyage afin de comprendre d'où vient le problème.
Vingt-six ans après la mort étrange d'une élève, un jeune garçon nommé Koichi Sakakibara fait la connaissance d'une camarade très mystérieuse à laquelle aucun autre élève ne semble parler ou prêter attention.
L'histoire se déroule dans un monde chaotique où les humains tentent de survivre face aux Kabane. Ikoma, vit désormais dans une forteresse pour se protéger. Mais il a la ferme intention de lutter pour survivre.