Suite à la prise d’otage d’un père désespéré et impuissant face à la maladie de son fils, l’équipe du service de médecine interne du docteur Proust à l’hôpital Madeleine-Brès, panse ses blessures, notamment la mort de Kevin. C’est dans ce contexte que Nina, encore plus amoureuse d’Hugo, découvre qu’elle attend un enfant de lui. Mais ce nouveau bonheur est entaché par une nouvelle préoccupante : Hugo découvre qu’il est malade...
Suite à la prise d’otage et à la mort de Kevin, le service du Dr Proust panse ses plaies. Tandis que Costa rejoint l’équipe soignante, Nina découvre comme un cadeau de la vie qu’elle est enceinte d’Hugo. Le truculent couple Vic et Rita revient consulter à l’hôpital. Rita est enceinte alors que Vic était censé avoir fait une vasectomie. Suite à une bagarre, Jonathan arrive bien amoché au 11ème...
S06E02 - A nos amours
Grâce au Dr Proust, l’hôpital bénéficie d’un sursis de 6 mois avant sa fermeture. Alors que Nina et Hugo savourent leur bonheur d’avoir un enfant, Hugo découvre qu’il est malade. Face à l’adversité, le couple est plus uni que jamais. Hospitalisé, Nicolas fait une grève de la faim pour obtenir la garde de son fils. Le 11ème se voit affecter deux nouveaux internes, Damien et Yasmine.
S06E03 - Le poids des souvenirs
Un mois est passé depuis le décès d’Hugo qui n’a pas survécu à son malaise. Bien que soutenue par Costa, Nina ne parvient pas à faire son deuil et à envisager l’avenir seule avec son enfant. La rencontre avec Barbara Carron, une patiente atteinte du syndrôme de Diogène suite au décès de son mari, va lui permettre de surmonter cette épreuve. Dorothée retrouve Rose, son ancienne esthéticienne, hospitalisée pour une reconstruction mammaire suite à un cancer du sein...
S06E04 - Engagements
Gloria annonce à Nina qu’elle est atteinte d’une pathologie liée à sa grossesse qui met en danger sa propre vie. Alors que la fermeture de l’hôpital approche, le 11ème voit débarquer tout un mariage. Alice, la mariée, n’a pas pu dire "oui". Et si ses symptômes avaient quelque chose à voir avec la maladie grave que Yannis, son futur mari lui a caché ? Damien, le jeune interne fraîchement affecté dans le service, voit arriver à l’hôpital, son frère Sylvain, zadiste engagé, qu’il n’a pas vu des années...
S06E05 - Crash
A la veille de la fermeture de l’hôpital qui s’est vidé de ses soignants et de son matériel, Nina, désormais enceinte de 7 mois, a choisi de travailler jusqu’au bout. C’est dans ces conditions que l’hôpital se voit contraint de prendre en charge les victimes d’un accident de la route qui a eu lieu tout à côté du site. Deux familles sont impliquées. D'un côté, un jeune homme, Redwane, et de l'autre une mère, Fanny et son fils Lucas. Tout désigne Redwane, ex-taulard, comme le responsable de l'accident. Mais Fanny dont le fils est gravement blessé, n'est peut-être pas si innocente que cela dans l'accident...
S06E06 - Un nouvel espoir
Alors qu’on fête la fermeture de l’hôpital, Nina accouche prématurément dans des conditions extrêmes. De son côté, Proust examine la surprenante requête du Dr Charrier, qui veut être euthanasié : il est persuadé d’avoir la maladie de Huntington comme son père, Mais c’est sans compter le zèle du Dr Proust qui n’est pas convaincu par son diagnostic…