En saison 3, retour derrière les barreaux pour Michael, Bellick, T-Bag et Mahone, à la prison de haute sécurité de Sona, au Panama (à ne pas confondre avec le sauna, beaucoup plus récréatif). Les audiences étant en baisse et les critiques assassines, les créateurs de la série décident de faire table rase de Sona. Dans l'avant-dernier épisode, Michael et trois détenus parviennent à s'évader, mais rien de très spectaculaire. Sauf qu'on apprend dans la saison 4 qu'après la fuite de Michael, T-Bag a mis le feu à Sona dans le but de provoquer une émeute pour permettre à tous les prisonniers de s'échapper. Tout ça... en hors-champ.
Et le mystérieux Whistler, qui était au centre de l'intrigue de la saison 3 ? Eliminé platement dès le début de la saison 4. La frustration est totale.
La bande-annonce de la saison 4 :