Une affaire locale du FBI impliquant deux femmes assassinées et une foule d'hommes puissants se transforme en une grande chasse à l'homme pour retrouver le dangereux chef d'une entreprise criminelle de grande envergure.
Chargés de retrouver le meurtrier d’un milliardaire, Jess LaCroix et son équipe collaborent avec les agents du FBI Maggie Bell et OA Zidan, qui enquêtent sur le meurtre d'une adolescente probablement tuée par le même homme. Au cours de ses investigations, l’équipe rencontre Kristin Gaines, agent spéciale du bureau de Miami.
S03E02 - L'assaut
Kristin Gaines, nouveau membre de l’équipe de Jess, rejoint le groupe qui se rend à Washington pour retrouver un fugitif ayant participé à l'assaut du Capitole.
S03E03 - Les survivants
Lorsqu'un juge connu pour avoir infligé de sévères peines à des mineurs est assassiné, l'équipe se penche sur sa longue liste d'affaires afin de retrouver son meurtrier. Kristin Gaines doit faire face à des problèmes de logement alors qu'elle se réinstalle à New York avec sa fille adolescente.
S03E04 - Manipulation génétique
Pour retrouver une jeune femme sino-américaine qui a été enlevée, l'équipe doit déterminer s’il s’agit d’un crime haineux aléatoire ou si la victime était spécifiquement visée. Par ailleurs, Jess et Sarah doivent faire face à la rébellion de Tali.
S03E05 - Soif de justice
Après un incendie mortel dans une salle d'arcade, l'équipe découvre que l'incendie n'était que la première étape d'un plan complexe visant à se venger de l'une des victimes. De retour dans l'équipe, Hana trouve de nouveaux ajustements dans tous les aspects de sa vie.
S03E06 - Jamais sans ma fille
L'équipe traque un criminel qui s’en prend à des familles et tente de l’arrêter dans sa folie meurtrière. Par ailleurs, la mère intrusive de Barnes met la pression sur son mariage.
S03E07 - À en perdre la tête
L'équipe enquête sur le meurtre de l’épouse d’une star du basket devenue influenceuse. Une affaire très médiatisée qui oblige l'agent spécial Isobel Castille à faire le point avec l'équipe. Kristin se rapproche de son ex-mari...
S03E08 - Un étalon en or
Un cheval de course de très grande valeur a été volé et sa soigneuse prise en otage. Pour l'équipe, la sécurité de la jeune femme est plus importante que celle du cheval, ce qui n’est apparemment pas l'avis de tout le monde. Byron revient pour célébrer les fêtes avec Jess et sa famille.
S03E09 - Terreur au centre commercial
Alors qu'ils font leurs courses de Noël, Sheryll et Jess sont pris au milieu d'une fusillade dans un centre commercial ; les sorties étant piégées pour que personne ne puisse s'échapper. Kristin, Hana et Ivan tentent d'apporter leur aide depuis l'extérieur.
S03E10 - Victimes du système
L’équipe traque un jeune homme qui utilise des bombes au napalm pour attaquer ses cibles. Par ailleurs, Jess et Sarah tentent de s'adapter à l’absence de Tali.
S03E11 - Engrenage mortel
Jess LaCroix dirige la division du FBI chargée de traquer et capturer les criminels en fuite les plus recherchés des États-Unis. Sous ses ordres, une équipe hautement qualifiée, véritable unité d'infiltration mobile, toujours sur le terrain et prête à tout pour traquer ceux qui tentent de disparaître pour échapper à la justice.
S03E12 - La cavale d'El Pincho
LaCroix et son équipe partent à la recherche d'un célèbre baron de la drogue colombien, qui s'est évadé d'une prison américaine. Kristin, de son côté, parle de son passé à son ex-mari...
S03E13 - Fermer les yeux
Le FBI se lance à la recherche d'un homme d'affaires soupçonné de meurtre et détournement de fonds, dont la famille a été assassinée. Jess profite d’être seul pour faire la cour à Sarah...
S03E14 - Quand tout bascule
L'équipe poursuit un homme violent à la recherche de son ex-petite amie, qui tente de lui échapper pour de bon. Jess et Sarah font des plans pour passer des vacances de rêve ensemble.
S03E15 - Un grand vide
Un membre d’une communauté misogyne s'en prend aux personnes qui, selon lui, ne lui ont jamais donné de chance. Tout en se lançant à ses trousses, l’équipe doit surmonter la disparition d’un des leurs...
S03E16 - Vie secrète
Les agents se rendent dans le Vermont après qu'un couple marié cultivant illégalement de la marijuana a massacré ses employés. Sheryll commence à regretter de ne pas avoir pris de congé pour s'occuper de son bébé...
S03E17 - Au nom du frère
Le charmant mais redoutable agent spécial Remy Scott prend ses nouvelles fonctions de chef d’équipe. Les agents vont enquêter sur une série d'homicides liés à un amour interdit entre une adolescente et son petit ami plus âgé.
S03E18 - À double tranchant
Remy et l'équipe enquêtent sur les homicides de deux vétérans de l'armée dans une série de meurtres liés à leur mission en Afghanistan. Par ailleurs, Hana reçoit des nouvelles surprenantes au sujet de sa mère biologique.
S03E19 - Petits arrangements entre amies
Lancée à la poursuite du tueur d'un homme sous protection de témoins, l'équipe découvre une affaire plus compliquée que prévu. Remy Scott est mis au défi en reprenant contact avec sa mère, Betsy.
S03E20 - L'affranchi
L'équipe met tout en œuvre pour retrouver un tueur qui recrée les meurtres d'un criminel notoire des années 80.
S03E21 - La femme aux mille visages
Les agents doivent découvrir l’identité d’une femme se faisant passer pour une entraineuse personnelle après le meurtre d’un couple dans les Hamptons. Ortiz se retrouve dans une situation difficile face à une faveur que lui demande le frère d’Hana.
S03E22 - Sans foi ni loi
L'équipe poursuit un oligarque qui sème la terreur à New York dans une tentative désespérée d'échapper à la situation dans laquelle il se trouve.