Un enfant pas comme les autres est l'adaptation sur grand écran de la nouvelle de science-fiction L'Enfant de Mars, écrite par l'Américain David Gerrold. Ce dernier officie d'ailleurs comme producteur exécutif sur le long métrage. La nouvelle L'Enfant de Mars a remporté de nombreuses récompenses à travers le monde, dont les prix Hugo etNebula.
Frère et soeur dans Un enfant pas comme les autres, John et Joan Cusack le sont aussi dans la vie. Ce film compris, ils ont figuré dix fois au même générique. Leurs neuf autres collaborations sont les suivantes : Class (1983), Sixteen Candles (1984) Grandview, U.S.A. (1984), Broadcast News (1987), Un monde pour nous (1989), Tueurs à gage (1997) Broadway 39e rue (1999) et High fidelity (2000) et War, Inc. (2009).
John Cusack a été enthousiasmé par le scénario d'Un enfant pas comme les autres. Il explique : "J'ai trouvé cette histoire aussi touchante qu'intrigante. Elle traite des rapports entre un homme et un petit garçon adopté, chacun tentant de comprendre et d'apprivoiser l'autre. J'ai aimé l'idée de cette relation parce qu'elle fait la part belle au jeu des acteurs. Cette histoire est à la fois moderne et fascinante, notamment grâce à ce petit garçon hors norme qui ne parvient pas à s'intégrer au monde. Il pense venir d'une autre planète et cette idée m'a semblé très intéressante. C'est une fable, une métaphore sur la solitude et sur notre incapacité à trouver notre place ici-bas. J'ai trouvé ça à la fois magnifique et émouvant."
Un enfant pas comme les autres marque les retrouvailles de John Cusack et Amanda Peet, six ans après le thriller Identity. Le film est aussi l'occasion de revoir sur grand écran la trop rare Anjelica Huston dans un petit rôle.
C'est à Steven Spielberg que Menno Meyjes, le réalisateur d'Un enfant pas comme les autres, doit ses premiers succès à Hollywood. Scénariste de The Mission, l'un des épisodes des Histoires fantastiques réalisées par le papa d'E.T, Meyjes a ensuite écrit le scénario de la Couleur pourpre et participé à l'écriture des scénarios de L'Empire du soleil et d'Indiana Jones et la Dernière Croisade.
Un enfant pas comme les autres est le quatrième long métrage réalisé par Menno Meyjes. John Cusack était d'ailleurs l'acteur principal de son premier film, Max, en 2002.
L'exposition sur Mars dans Un enfant pas comme les autres a exigé la création d'un plateau de tournage impressionnant, création à laquelle a participé la NASA (National Aeronautics and Space Administration). L'agence a fourni les images de la planète Mars défilant en continu sur de nombreux écrans ainsi qu'une reproduction de sonde spatiale.