Marie et le loup a été présenté lors de la Berlinale 2003, dans la section Forum.
L'inspiration de Marie et le loup est venue à sa réalisatrice Eve Heinrich d'un fait divers : "Il s'agit d'une femme qui se pensait l'objet d'une menace, un cas de paranoïa aigu. Finalement, elle tue son agresseur supposé, qui bien évidemment n'était coupable de rien".
Connue comme scénariste et réalisatrice, Zaïda Ghorab-Volta trouve dans Marie et le loup son premier rôle. Pour la réalisatrice Eve Heinrich, c'était une évidence : "Dans le scénario, Marie était une blonde aux yeux bleus, mais aucune actrice blonde ne parvenait à me plaire. Un jour, sur le tournage d'un court-métrage, j'ai vu Zaïda sortir de sa chambre, les cheveux en bataille, pieds nus.Elle avait quelque chose de rude et de très séduisant à la fois. J'ai compris que c'était une femme comme elle qui devait jouer Marie. (...) Je suis revenue à Zaïda, alors qu'elle était devenue mon interlocutrice en production, ce qui pouvait être délicat. Mais j'ai voulu tenter cette expérience."
Ce n'est qu'après le tournage que Marie et le loup a hérité de ce titre énigmatique. Initialement nommé Nationale 1, le projet s'est teinté de références aux contes, qui éclairent son nouveau titre :"Le film terminé, précise la réalisatrice Eve Heinrich, cette fille en rouge, cette forêt, ces craintes qui saisissent Marie, tout à coup je reconnaissais tout comme dans un conte. J'ai voulu pointer cela à travers le titre. Je suis partie du thriller pour aller au conte."
Le compositeur de la bande-originale de Marie et le loup est un musicien de jazz : Benjamin Moussay, qui est pianiste, a sorti son premier album, Mobiles, à la fin de l'année 2002.