Le réalisateur Michael Curtiz et l'acteur Errol Flynn collaboraient pour la huitième fois ensemble après Le Capitaine Blood, réalisé en 1935, La Charge de la Brigade Légère (1936), Un homme a disparu (1937), Les Aventures de Robin des Bois (1938), Quatre au Paradis (1938), La Vie Privée d'Elisabeth d'Angleterre (1939), Les Conquérants (1939). L'Aigle des mers représente l'apogée de ce duo au sein de la Warner. Les collaborations entre les deux coïncident à la meilleure période du réalisateur. Michael Curtiz dirigea l'acteur dans trois autres films : La Caravane héroïque (1940), La Piste de Santa Fé (1940) et leur ultime collaboration, Dive Bomber (1941).
Le sujet du film, situé à l'époque où l'espagne et l'Angleterre se disputaient la maîtrise des océans, évoque l'inéluctable entrée en guerre des Etats-Unis lors de la seconde Guerre Mondiale. Le film apparaît alors comme une curieuse parabole politique sur l'Amérique de 1940 face au nazisme.