Suite à l’échec de la campagne de crowdfunding et ce, 3 semaines avant le début du tournage, l’équipe se retrouve sans un sou et sans décors. C’est alors qu’un mécène permet le lancement du tournage en injectant la somme de 1000 euros dans le projet. Cohabitation a continué par la suite à être financé au fur et à mesure et selon l’argent de poche disponible de l’équipe. Entre le premier jour de tournage et la fin de la post-production il s’est écoulé plus de 18 mois.
Pendant la séquence de ratonnade sous le métro aérien, l’équipe de tournage, tenue à distance par le dispositif de mise en scène, n’a pu empêcher un passant qui voulait s’interposer. Il a été arrêté in extremis par l’acteur jouant le rôle du réfugié haïtien au moment où le « super passant » s’apprêtait à en découdre avec les acteurs jouant les Bonehead.