Voilà 15 ans que Raphael Delpard n'avait plus réalisé de films. Pour son retour dans le cinéma, il signe une réalisation tiré d'un livre dont il est lui-même l'auteur. Le livre Les convois de la honte : Enquête sur la SNCF et la déportation (1941-1945) est paru en 2004 aux éditions Lafon.
Le tournage du film s'est fait entre Châlon-sur-Saône (Bourgogne) et le Vivarais (Ardèche) et a mis à contribution une quinzaine de bourguignons professionnels de l'audiovisuel.