Dans le Japon du XVIIe siècle. Le samouraï Iemitsu déteste son fils aîné Takechiyo. Il reporte toute son affection sur son plus jeune fils Tokumatsu. Un jour, Takechiyo, à l'aide d'une puissante armée, décide de se retourner contre son père...
Un aveugle arrive dans la petite province de Shimosa. Nommé Ichi, il se fait vite connaître pour ses talents de masseur et pour son habileté surnaturelle aux dés. Mais, les habitants se rendent compte d'un autre de ses talents, le maniement de l'épée...
Zatôichi a été manipulé par le chef yakusa d'une maison de jeu. Ce dernier en ressort plus puissant que jamais. Zatôichi a désormais deux objectifs : rétablir l'injustice qu'il a contribué à provoquer, et venir en aide à la femme qu'il a involontairement condamnée à la prostitution en tuant son mari lors d'une embuscade...
En 1860, Niino, un samouraï sans maître, aspire à la gloire, mais, né de père inconnu, il ne peut justifier d'une lignée favorable. Il tente de parvenir à ses fins en se mettant au service d'un clan et de ses alliés, mais ces derniers ambitionnent de tuer un haut dignitaire du Shogunat pour régner à sa place...
Ogami voyage à travers le Japon avec son fils. Ce samouraï renommé devient bientôt un tueur, uniquement pour sauver une jeune fille. Il va devoir affronter l'homme le plus puissant de la région...
Un village vit sous la coupe de Boss Masagoro, un fils de marchant et soupçonné d'avoir volé les réserves d'or du Shogunat. Masagoro engage alors Yojimbo comme garde du corps. Mais ce dernier se révèle en fait être un espion à la solde du Shogunat...
Itto Ogami, célèbre dans tout le Japon, est un ex-bourreau du Shogun. Il offre ses services de tueur à gages au plus généreux. Traqué par le gang Yagyu, ce-dernier lance un groupe d'amazones sanguinaires aux trousses d'Itto, qui est aussi poursuivi par les trois Maîtres de la Mort...
Oyuki est une femme qui séduit les hommes à l'aide de ses tatouages. Itto Ogami, lancé à ses traces pour la tuer, découvre qu'elle n'a qu'un but : le tuer elle aussi. De son côté, Daigoro croise la route d'un sabreur de renom, désireux d'éliminer Ogami.
La rencontre de deux figures légendaires -et infirmes- du film de sabre asiatique : Zatoichi, le masseur aveugle, côté japonais, et le sabreur manchot, son alter-ego chinois.
Après qu'il ait accidentellement été à l'origine du décès d'une vieille femme, Zatoichi part annoncer la nouvelle à la fille de la défunte. Sur son chemin, il doit affronter la mafia et l'amant d'une prostituée qu'il tente de secourir.
Suite à une promesse passée à une mourante, Zatoichi se rend dans un village pour y rencontrer un artiste-peintre, victime des malversations d'un homme politique local.
Ishikawa Goemon met la main sur un objet secret, ce qui provoque la colère du sanguinaire Toyotomi Hideyoshi. Sa tête mise à prix, le voleur virtuose va rapidement se retrouver au centre d'un écheveau de vengeances et de complots.
Zatoichi devient l'hôte d'un patron de yakuzas. En échange de ce service, le brigand lui demande d'assister à une exécution. Mais les hommes ne parviennent pas à tuer la victime, et c'est Zatoichi qui s'en charge...