L'été dernier, le président de la chaîne FOX laissait entendre que, malgré de mauvaises audiences, une saison 3 de Wayward Pines était encore possible : "Nous avons récemment discuté avec M. Night Shyamalan sur ce à quoi une 3e saison pourrait ressembler. Nous allons prochainement nous réunir pour en parler plus en détails, réfléchir à de potentielles intrigues et des idées de casting. Aucune décision n'a été prise pour le moment, mais on y pense."
Selon le site TV Line, la décision a enfin été prise des mois plus tard et, comme ce silence de près de deux ans pouvait le laisser supposer, Wayward Pines ne reviendra pas.
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