1923. Les vampires existent depuis déjà quelques temps. Mais un mystérieux virus, une source de sang artificielle appelée "Ascra", fait croître leur nombre. Afin de le contrer, le gouvernement a créé au sein de l'armée "Code Zero", une unité utilisant des vampires pour combattre les vampires. Historiquement créée par le lieutenant-général Nakajima, cette unité était chargée de récolter les informations de guerre. Désormais assignée à la chasse aux vampires, l'unité Code Zero a pour mission de stopper le mystérieux virus, avant que celui-ci ne provoque l'effondrement de la société.