McGarrett, Danny et toute les forces de l'odre du 5-0 poursuivent leur lutte contre le crime, sur les plages paradisiaques d'Hawaii comme dans ses recoins les plus lugubres. Ils sont aidés dans leur tâche par de nouvelles connaissances et d'anciens amis, venus leur prêter main forte. Ils s'intéressent notamment à une affaire non résolue datant des années 40 sur laquelle le grand-père de McGarrett a travaillé.
Lorsqu'il découvre un ancien compagnon d'Afghanistan et agent de la CIA échoué sur la plage, McGarrett est persuadé que son meurtre a été déguisé en noyade. Son enquête va mener le 5-0 vers d'autres meurtres d'agents et un navire d'espionnage chinois…
S09E02 - Ke Kanaka I Ha'ule Mai Ka Lewa Mai
En plein milieu d'un vol en direction d'Honolulu, un père de famille se fait kidnapper et est forcé à sauter en parachute. Danny, Tani et Junior tentent de le retrouver dans la jungle. Ils se rendent compte très vite que cet homme n'est peut-être pas ce qu'il semble être. McGarrett est menacé par un secret concernant son passé…
S09E03 - Mimiki Ke Kai, Ahuwale Ka Papa Leho
Une vague de chaleur frappe Oahu et entraîne une entraîne une augmentation de la criminalité sur l'île. Tandis que l'équipe du 5.0 tente de retrouver une braqueuse de banque ayant tué plusieurs personnes, Tani et Junior se font voler leur voiture de fonction.
S09E04 - A'ohe Kio Pohaku Nalo i Ke Alo Pali
Le 5-0 enquête sur le meurtre d'une personne découverte dans une cargaison de sable illégal ; le corps ayant été aspiré lors du dragage en mer. Par ailleurs, Jerry accompagne Junior, désigné pour rapatrier le corps d'un jeune sergent-chef sur Oahu.
S09E05 - A'ohe Mea 'Imi A Ka Maka
À Halloween, Jerry organise un week-end avec ses amis dans leur ancien camp de vacances afin d'élucider un crime auquel il aurait assisté dans sa jeunesse. De son côté, le 5-0 enquête sur le meurtre d'une femme rousse aux yeux bleus, dont une petite fille aurait dessiné la scène de crime avant que la police ne la découvre…
S09E06 - Aia I Hi'ikua; I Hi'Ialo
Un ancien soldat et ami de Steve succombe d'une blessure par balle après un atterrissage d'urgence sur un porte-avion avec un bébé non identifié à bord. Bien que l'agent Emma Warren du NCIS le lui interdise, McGarrett mène l'enquête pour innocenter son ami.
S09E07 - Pua A'e La Ka Uwahi O Ka Moe
Milton Cooper, lieutenant retraité, confie à Steve et Danny une mallette contenant l'enquête sur la disparition non résolue d'une danseuse en 1932. En 1941, Milton et le grand-père de Steve enquêtaient sur cette affaire ; la seule que le célèbre inspecteur d'Honolulu Chang Apana n'avait pas réussi à élucider…
S09E08 - Lele Pu Na Manu Like
Alors que Lou reçoit sa famille pour Thanksgiving et s'écharpe avec son frère, le 5-0 enquête sur la mort d'un cambrioleur et recherche son possible complice, qui s'est emparé d'une carte de baseball ancienne de grande valeur.
S09E09 - Mai Ka Po Mai Ka 'O'ia'i'o
Un justicier agissant au nom des citoyens et surnommé « La sentinelle de la nuit » est abattu alors qu'il tentait d'arrêter un dealer. Le 5-0 utilise les vidéos de ses arrestations ainsi que des bandes-dessinées de sa vie pour remonter jusqu'au tueur…
S09E10 - Pio ke kukui, poele ka hale
McGarrett et Joe White affrontent des tueurs engagés pour les abattre en représailles d'une mission au Maroc en 2002 en tant que Navy Seals.
S09E11 - Hala I Ke Ala O'i'ole Mai
Steve, Catherine, Danny, Junior, Harry Langford et un vieil ami de Joe White s'unissent pour traquer le commanditaire des meurtres de Navy Seals, ainsi que l'ex agent de la CIA qui a livré leurs noms. Par ailleurs, sur l'île, le 5-0 enquête sur le meurtre de deux hommes qui venaient de découvrir des ossements humains dans un box acheté aux enchères.
S09E12 - Ka Hauli O Ka Mea Hewa 'Ole, He Nalowale Koke
Grace Williams, la fille de Danny, est retrouvée dans un état critique après un accident de voiture. Les traces d'huiles d'un second véhicule convainquent Steve qu'il ne s'agissait pas d'un accident. Par ailleurs, Tani aide son frère à retrouver une amie disparue après une cure de désintoxication.
S09E13 - Ke Iho Mai Nei Ko Luna
Un professeur d'océanographie travaillant dans un laboratoire de recherche en eaux profondes est retrouvé mort sur la plage. Adam, Junior et Tani se rendent donc dans ce laboratoire sous-marin pour débusquer le meurtrier parmi les membres de l'équipage scientifique…
S09E14 - Ikliki I Ka La O Keawalua
Le meurtre d'un ami de Flippa et le vol de sa fourgonnette conduisent le 5-0 à découvrir un projet d'attentats fomenté par un groupe néo-nazi.
S09E15 - Ho'opio 'Ia E Ka Noho Ali'i A Ka Ua
Un ouragan sévissant à Oahu, le quartier général du 5-0 devient un abri anti-tempête pour des centaines de civils, mais également pour un dangereux criminel, surnommé « El diablo », tout juste arrêté par le FBI et en attente d'évacuation vers le continent…
S09E16 - Hapai Ke Kuko, Hanau Ka Hewa
Une brillante commerciale d'une société de beauté et bien-être meurt empoisonnée alors qu'elle participait à un camp de sirènes. Le 5-0 passe au crible une longue liste de suspects potentiels pendant qu'Adam vient en aide à un sans-abris qui s'est éloigné de sa famille…
S09E17 - E'ao Lu'au A Kualima
Le 5-0 tentent d'identifier les braqueurs d'une banque ayant provoqué la mort d'un policier. En découvrant que l'un d'eux est le compagnon de son ex petite-amie, Junior est tiraillé entre son devoir et ses sentiments…
S09E18 - Ai No I Ka 'ape He Mane'o No Ko Ka Nuku
Danny et Steve jouent les gardes du corps pour l'ex-belle-mère de Danny, Amanda Savage, avec qui il ne s'est jamais entendu. Par ailleurs, le 5-0 enquête sur un lot mortel de stéroïdes ayant entraîné la mort de deux personnes…
S09E19 - Pupuhi ka he’e o kai uli
Le 5-0 fait appel à l'expert en art Gerard Hirsch pour résoudre le meurtre d'un artiste de rue anonyme mais néanmoins très célèbre, tandis que Grover et Adam enquêtent sur la mort d'un parieur.
S09E20 - Ke Ala O Ka Pu
Les membres du 5-0 enquêtent sur le meurtre d'un homme, tué avec une arme achetée la veille par une adolescente. Ils découvriront alors que cette arme a servi dans de multiples homicides depuis plus de 40 ans, dont certains ont affecté leurs vies...
S09E21 - He Kama Na Ka Pueo
Le 5-0 enquête sur le meurtre d'un ancien policier, devenu détective privé et engagé par un père à la recherche de sa fille, kidnappée 20 ans plus tôt.
S09E22 - O Ke Kumu, O Ka Mana, Ho'opuka 'ia
Adam et le 5-0 enquêtent sur la disparition d'un agent infiltré du FBI sur le point d'épouser la fille d'un chef Yakuza. Par ailleurs, Noelani est prise en otage pour pratiquer une opération sur un criminel avec son mentor, le Dr. Chu...
S09E23 - Ho‘okāhi no lā o ka malihini
L'équipe enquête sur les meurtres d'un chauffeur et de son client tandis que McGarrett reçoit la visite de sa sœur Mary qui va l'entraîner dans une enquête sur un voisin suspect...
S09E24 - Hewa ka lima
Aaron Wright, un ancien pirate informatique désormais employé par la NSA, demande l'aide du 5-0 après le meurtre de ses collègues. Par ailleurs, Lou aide son frère Percy qui s'est fait voler une recette et Junior témoigne lors de la libération conditionnelle du chauffard qui a tué sa sœur...
S09E25 - Hana Mao 'ole ka ua o Waianae
McGarrett et son équipe tentent de retrouver Aaron Wright avant qu'il vende au plus offrant les cyber-armes volées à la NSA…