C'est l'élection des délégués de classe. Jérémy, qui ne pense être en rivalité qu'avec Hervé, est certain d'être élu. Mais il se retrouve face à un adversaire inattendu, Odd. En effet, ce dernier a décidé de se faire élire pour représenter les élèves de sa catégorie, les cancres. Par ailleurs, les cinq amis découvrent que Xana a un objectif inquiétant : détruire les Territoires de surface. En effet, ce sont les seuls accès au cinquième territoire pour les héros. Sans eux, Xana aura tout le loisir de détruire le monde virtuel.
S03E03 - Raz de marée
S03E04 - Fausse piste
S03E05 - Aelita
S03E06 - Le prétendant
S03E07 - Le secret
S03E08 - Une tarentule au plafond
S03E09 - Sabotage
S03E10 - Désincarnation
Jérémie pense avoir trouvé le moyen de virtualiser ses amis directement dans le cinquième territoire. Ulrich est désigné pour tester le programme.
S03E11 - Triple sot
S03E12 - Surmenage
S03E13 - Dernier round
S03E14 - Le Réveil de XANA (Partie 1) Genèse
Jérémie découvre sur les écrans d'un mystérieux ordinateur une jeune fille virtuelle en détresse. Alors qu'il entame des recherches, il est la cible d'attaques aussi mystérieuses qu'électriques. Jérémie confie son secret à Ulrich Stern, son camarade de classe, ainsi qu'au nouveau venu dans le collège, Odd Della Robia et à une jeune japonaise taciturne et fan d'arts martiaux, Yumi Ishiyama. Devenus inséparables, ils vont pénétrer dans un monde virtuel et en découvrir tous les dangers !
S03E15 - Le Réveil de XANA (Partie 2) Genèse
Sur terre, nos héros vont devoir faire face à une attaque électrique hors du commun… et, pénétrant le monde virtuel, en découvrir tous les dangers. Au terme de cette première aventure palpitante, Jérémie, Ulrich, Odd, Aélita (la jeune fille virtuelle) et Yumi seront devenus inséparables et comprendront qu'en rallumant le Supercalculateur, ils ont également réveillé un ennemi aussi puissant qu'inattendu : Xana, programme informatique belliqueux dont l'objectif semble être de les anéantir. Mais malgré cette menace, ils sont bien décidés à libérer Aélita de sa prison virtuelle. Ensemble, les nouveaux héros jurent donc de poursuivre la lutte contre Xana et… de garder le secret !