Après le crash d’un avion expérimental piloté par un capitaine de la Navy, Jane Tennant obtient que l’enquête soit menée par le NCIS. La victime, qui avait tenté de contacter le NCIS la veille de sa mort, aurait succombé à une overdose que les agents ne croient pas accidentelle…
S01E02 - Braquage
Le NCIS enquête sur des braquages meurtriers, réalisés avec des explosifs et des tactiques militaires. L’équipe craint que les premiers braquages ne soient qu’une diversion pour une action de plus grande envergure…
S01E03 - La recrue
Kai infiltre l’un des plus anciens gangs de surfeurs d'Hawaï après le meurtre d’un officier de la Navy. Ce dernier tentait d’aider des jeunes en difficulté à changer de vie en s’engageant dans la Marine.
S01E04 - Au nom du fils
L’officier Kaleo Whitman reçoit une balle en faisant du cheval dans les montagnes, et affirme au NCIS qu’il s’agit d’un accident de chasse avant de s’enfuir de l’hôpital. L’équipe découvre que Whitman a été aidé dans sa fuite par un cowboy hawaïen, qui s’avère être son cousin…
S01E05 - Faux-semblants
Lorsqu’un quartier maître japonais est tué sur le sol américain, le NCIS doit trouver le coupable avant que l'affaire ne provoque une crise diplomatique. Supervisée par le Chef d’État-Major adjoint Joe Milius, l’enquête se tourne vers Abby Nelson, suspectée d’avoir tué l’ancienne petite amie de la victime…
S01E06 - Double vie
Le NCIS enquête sur l’enlèvement d’une influenceuse, venue fêter sa lune de miel à Hawaï avec son mari sous-officier. L’équipe découvre que la touriste n’est pas celle qu’elle prétend être…
S01E07 - De l'ombre à la lumière
Lorsqu’un sous-officier de la Navy est retrouvé mort sur la plage, Tennant et son équipe doivent mener l’enquête tout en protégeant la famille de la victime.
S01E08 - Retour aux sources
Lors de la cérémonie de restitution de terrains de la Navy au peuple hawaïen, le corps d’une activiste écologiste est découvert. La victime militait auprès d’un groupe venu manifester sur l’île pour que le milliardaire Damian Davenport rende les 39 hectares de sa propriété au Hawaïens…
S01E09 - L'imposteur
Un squelette portant un ancien uniforme de la Navy est découvert sur une plage. L’enquête, qui intervient durant les préparatifs de la commémoration des 80 ans de Pearl Harbor, conduit le NCIS à un ancien combattant désormais centenaire…
S01E10 - Meurtre sur les docks
Après le meurtre d’un inspecteur portuaire, retrouvé dans un conteneur avec des pièces détachées d’armement militaire, le NCIS croise l’équipe de Whistler, qui enquête sur un trafic d’armes. Parallèlement, Tennant hésite à arrêter le père d’une amie d’Alex…
S01E11 - Coup de poker
Quand les preuves pour arrêter un baron de la drogue sont volées, Lucy part sous-couverture dans un tournoi de poker illégal pour découvrir qui est derrière ce crime. Aussi, les sentiments de Lucy sont dans la tourmente quand l'ex-petite-amie de Whistler arrive en ville.
S01E12 - Bons baisers de Chine (1)
Quand le NCIS enquête sur la mort mystérieuse d'un ingénieur de la Navy, Joseph Chan, ils apprennent que la dernière personne qu'il a vue est sa collègue : Maggie Shaw, l'amie et mentor de Jane, qui a été enlevée. Aussi, David Sola, un officier des renseignements néo-zélandais arrive à Hawai'i, suivant une piste dans son affaire qui lie la mort de Joseph Chan à un agent secret chinois.
S01E13 - Bons baisers de Chine (2)
Alors que Jane enquête sur l'enlèvement de Maggie, elle est choquée lorsqu'elle apprend la vérité et embarque son équipe et Whistler pour trouver des preuves à ses découvertes.
S01E14 - Rupture
Pendant que Jane est interrogée à la suite de l'arrestation de Maggie Shaw, le reste de l'équipe enquête sur un cas mystérieux de Marines dont les canaux auditifs ont été endommagés par des vagues d'ultrasons. Enfin, Ernie rend vite à son ami, le Docteur Tony Lee, pour identifier de possibles suspects qui auraient pu avoir accès à cette arme classifiée.
S01E15 - Kidnapping en haute mer
Au cours d’une journée père-fille, Jesse part naviguer avec la classe de voile de sa fille Gracie, 15 ans. En pleine mer, des pirates prennent le contrôle du voilier et les passagers en otage. Jesse ayant pu prévenir Tennant, le NCIS lance les recherches, en collaboration avec le FBI et les garde-côtes.
S01E16 - Les liens du sang
Kai part sous couverture en tant que chef dans un restaurant local pour acquérir des informations sur un criminel notoire qui a des connexions dans le restaurant. Aussi, Jane découvre qu'une école sur le continent veut recruter Alex et lui offrir une bourse pour le baseball, ce qu'il a caché à toute sa famille.
S01E17 - La faille
Quand une attaque informatique cause des problèmes dans le fonctionnement d'un barrage, Ernie et une équipe de hackers sont chargés de réparer les dégâts rapidement, avant que l'électricité et l'eau ne soient coupées partout sur l'île. Aussi, Lucy et Whistler travaillent ensemble, donnant une chance à Whistler de s'excuser auprès de Lucy et leur donnant une chance de travailler sur leur relation.
S01E18 - T.N.T
Nick Torres se rend à Hawaï pour suivre une piste dans le cadre de son enquête sur la mort d’un Marine dans une explosion de munitions en Afghanistan 5 ans plus tôt. Les deux agences du NCIS vont alors collaborer pour enquêter sur la société militaire privée responsable de l’incident, Fortress.2ème partie du cross-over avec "NCIS".
S01E19 - Le cri d'une lionne
Le NCIS enquête sur le naufrage d’un navire transportant des animaux exotiques qui a causé la mort d’un officier, attaqué par un prédateur, et menace désormais la biodiversité d'Oahu. Ernie offre à Lucy une séance chez un chaman hawaïen et Alex se blesse en jouant au baseball, entrainant une longue convalescence…
S01E20 - Dans la ligne de mire
À la veille du week-end, l’équipe est mobilisée sur un meurtre impliquant un Marine qui arrondissait ses fins de mois comme chauffeur de taxi. Lors de cette enquête, Lucy découvre que Kate a refusé une promotion à Washington pour rester à Hawaï.
S01E21 - Le pouvoir de l'amour
De retour à Hawaï pour un échange secret de prisonniers avec la Russie, le capitaine Milius demande à Tennant de l’accompagner aux Philippines, où l’échange aura lieu, pour qu’elle assure sa sécurité personnelle.
S01E22 - Sur le fil
Le capitaine Milius continue de collaborer avec Tennant et son équipe après l’échec de l’échange de prisonniers. Leur enquête va tenter d’identifier qui essaie d’exacerber les tensions entre la Russie et les États-Unis…