Alexandre Charlot débute sa carrière de scénariste à la télévision, écrivant durant quatre ans (de 1996 à 2000) pour Les Guignols de l'info, avec Bruno Gaccio et Franck Magnier.
En 2002, il commence à écrire pour le cinéma, signant le scénario d'un film fantastique (Maléfique) d'Eric Valette avec son ami Franck Magnier, dans lequel joue notamment Cornillac. Après un passage à vide, il revient en 2008 avec le scénario d'Astérix aux Jeux Olympiques, également avec Clovis Cornillac. C'est aussi en 2008 qu'il coécrit avec Franck Magnier et Dany Boon l'immense succès Bienvenue chez les Ch'tis.
A l'aise dans le registre comique, il poursuit dans cette voie (RTT, de Frédéric Berthe), s'essayant toutefois au thriller avec Une affaire d'Etat (où il retrouve Eric Valette).
En 2009, il passe à la réalisation, et tourne, avec son comparse de toujours, Franck Magnier, Imogène McCarthery, une comédie policière dans laquelle Catherine Frot incarne une secrétaire loufoque chargée d'une mission secrète. Deux ans plus tard, ils réalisent ensemble l'adaptation de la bande dessinée Boule et Bill, avec, dans les rôles des parents de Boule, Marina Foïs et Franck Dubosc.