Née d'une mère britannique et d'un père français, Emma Mackey se rend en Angleterre après l'obtention de son baccalauréat littéraire pour faire du théâtre. Elle s’inscrit ainsi en lettres classiques à l'université de Leeds et joue dans des productions de la troupe de la faculté.
Parallèlement, la jeune femme fait ses premiers pas sur le petit écran dans la série Sex Education où elle donne la réplique à Gillian Anderson et Asa Butterfield. Elle incarne la rebelle Maeve, qui entraîne ses amis dans la création d’une cellule de thérapie sexuelle clandestine au sein de leur lycée.
Sa carrière lancée, elle décroche le premier rôle féminin de Eiffel, à la croisée du film historique (l'aventure épique de la construction de la Tour Eiffel) et de la romance (entre le célèbre constructeur Gustave Eiffel et son amour de jeunesse retrouvé Adrienne Bourgès).
Début 2022, on pourra la voir dans Mort sur le Nil, nouvelle adaptation de l'oeuvre d'Agatha Christie par Kenneth Branagh.