Emmanuel Gillibert débute sa carrière en tant que réalisateur dans la publicité. Il joue en 2010 aux côtés de Julie Gayet, Denis Podalydès et Mathieu Busson dans 8 fois debout de Xabi Molia et écrit en parallèle le scénario du film Les Dents, pipi et au lit avec sa coscénariste Marion Thierry.

En 2016, il réalise un court métrage avec Louise Bourgoin, qui représente une des scènes clefs de Les Dents, pipi et au lit, avant de réaliser la version du long métrage en 2017. En 2022, il écrit et réalise son deuxième long métrage : La Tête dans les étoiles.