Après des débuts sur les planches, Jean-Louis Faure se spécialise rapidement dans le doublage. Il est ainsi la voix française d'Arnold Schwarzenegger dans le documentaire Pumping Iron II ou celle de Cary Grant dans une nouvelle version de L'Impossible Monsieur Bébé.
Mais c'est en devenant la voix VF de Bryan Cranston que Jean-Louis Faure devient très populaire auprès du grand public. Entre 2000 et 2006, il prête sa voix au personnage culte du père de famille Hal dans la série Malcolm puis "incarne" Walter White dans Breaking Bad.
Jean-Louis Faure, très actif pour la télévision, donne de la voix pour un nombre incalculable de séries parmi lesquelles Lucifer et Six Feet Under. Il est par ailleurs bien connu des fans de Game of Thrones pour avoir prêté sa voix au personnage de l'ancien contrebandier Davos Mervault, joué par l'Irlandais Liam Cunningham.
A noter enfin qu'outre celle de Bryan Cranston, Jean-Louis Faure est également la voix française de Jeffrey Wright depuis 2005. L'acteur a ainsi doublé l'Américain dans les James Bond Casino Royale, Quantum of Solace et Mourir peut attendre, dans la saga Hunger Games ainsi que dans The Batman pour le rôle du commissaire Gordon.