Un jeune britannique bohême, qui vit à Paris, se marie avec une danseuse. Il la persuade de renoncer à sa carrière sur scène, et ils s'installent dans un chalet du pays. Mais elle accepte une invitation de son ancien manager pour danser à une réception...
La guerre de Sécession. Deux familles éprouvées : les Stoneman (favorables au Nord) et les Cameron (sudistes). Le retour de la paix ne calme pas les esprits. Lincoln est assasiné. Les troubles naissent des politiciens véreux et des Noirs livrés à eux-mêmes. Par réaction se crée le Ku Klux Klan justicier et vengeur.
A travers l'image d'une femme berçant un enfant, quatre épisodes de l'intolérance sont racontés dans une fresque monumentale. Un épisode moderne sur un gréviste condamné à la pendaison. Un épisode biblique lors d'une noce à Cana. Un épisode des guerres de religion au temps de Charles IX. Un épisode chaldeen. Dans tous l'intolérance ...
Séduite et abandonnée alors qu'elle est enceinte par le riche Lennox Sanderson, la jeune et modeste Anna Moore se retrouve seule. Après le décès de son enfant baptisé Trust Lennox, elle se retrouve au service de la famille Bartlett. Le fils de la famille, David, tombe amoureux d'elle mais elle le rejette à cause de son passé, qu'elle garde ...