La mer à l'aube a reçu de nombreux prix, dont le FIPA D'or 2012 de la meilleure interprétation masculine pour Léo-Paul Salmain dans le rôle de Guy Môquet, ainsi que le Prix du Meilleur réalisateur au Festival des créations télévisuelles de Luchon 2012. Le film a également été sélectioné à la berlinale 2012, dans la catégorie « panorama ».