Il y a bien longtemps, dans une galaxie très lointaine... La Fédération du Commerce impose par la force la taxation des routes commerciales à la pacifique planète Naboo. Les chevaliers Jedi Qui-Gon Jinn et Obi-Wan Kenobi sont envoyés sur place...
Situé entre les épisodes III et IV de la saga Star Wars, le film nous entraîne aux côtés d’individus ordinaires qui, pour rester fidèles à leurs valeurs, vont tenter l’impossible au péril de leur vie. Ils n’avaient pas prévu de devenir des héros, mais dans une époque de plus en plus sombre, ils vont devoir dérober les plans de l’Étoile de la Mort, l’arme de destruction ultime de l’Empire.
La Guerre des Clones fait rage. Une franche hostilité oppose désormais le Chancelier Palpatine au Conseil Jedi. Anakin Skywalker, jeune Chevalier Jedi pris entre deux feux, hésite sur la conduite à tenir...
Malgré la destruction de l'Etoile Noire, l'Empire maintient son emprise sur la galaxie, et poursuit sans relâche sa lutte contre l'Alliance rebelle. Basés sur la planète glacée de Hoth, les rebelles essuient un assaut des troupes impériales...
La sénatrice Padmé Amidala échappe de justesse à un attentat. Le Padawan Anakin Skywalker est chargé de sa protection. Son maître, Obi-Wan Kenobi, enquête sur cette tentative de meurtre et découvre la constitution d'une mystérieuse armée de clones.
Les événements survenus durant la Guerre des Clones, située entre les événéments de "Star Wars : épisode II - L'Attaque des clones" et "Star Wars : épisode III - La Revanche des Sith".