Shin Captain Tsubasa est la suite de Captain Tsubasa (Olive et Tom). Cette suite se situe juste après la finale contre la Toho, évoquée à la fin du dernier épisode d'Olive et Tom Champions de Foot . Tous les meilleurs jeunes joueurs du Japon présents dans la première série sont maintenant des partenaires de jeu et forment la sélection junior japonaise. On y découvre des débuts laborieux lors de la préparation pendant laquelle l'équipe peine contre des clubs européens. L'équipe va beaucoup mieux lorsque son leader Tsubasa (Olivier en France) intègre l'équipe plus tard que les autres à cause de sa blessure lors du championnat Japonais. Cette série est l'occasion de revoir Misaki (Ben Becker) qui lui aussi rejoint la sélection Japonaise junior. L'équipe au complète, elle ira défier les meilleurs nations du monde lors d'un championnat européen ! On découvre de nouveaux grand talents tel que Pierre, Napoléon, Schneider, Diaz....