Kazuki perd la vie en tentant de venir en aide à une jeune fille poursuivie par un monstre. Touchée par son sacrifice, celle-ci le ressuscite avec un coeur alchimique. A présent, Kazuki, devenu un guerrier alchimique, doit lutter contre les homoncules, des êtres artificiels qui s'attaquent aux êtres humains...