Jim et Carlos sont chargés d'une nouvelle enquête : élucider la mort d'un milliardaire, qui avait prévu de léguer sa fortune à un groupe de passionnés de phénomènes paranormaux. Alors que la police cherche le meurtrier, les héritiers du défunt affirment qu'il a été enlevé par des extraterrestres. Jim écarte toute piste surnaturelle et soupçonne la jeune et belle épouse du milliardaire de l'avoir tué pour récupérer sa fortune avant qu'il ne finalise son testament. Pendant ce temps, Callie a refusé un poste à Atlanta, ce qui lui permet de rester auprès de Jim. Mais il lui faut maintenant trouver un nouvel emploi...
S03E02 - Le chant des sirènes
Le corps d'une jeune femme portant une queue de sirène est retrouvé échoué sur une plage. La victime était la vedette d'un spectacle de danse aquatique au sein duquel Jim suspecte plusieurs personnes, dont la soeur de la victime et le capitaine de l'équipe...
S03E03 - Jim's Anatomy
Jim accompagne Callie à Atlanta et l'aide à s'installer dans son nouvel appartement. La séparation est difficile. A Tampa, pendant ce temps, alors qu'il dispense un cours d'autopsie, le légiste Carlos Sanchez découvre que l'homme dont le corps est ainsi examiné et disséqué devant l'auditoire a été assassiné. Jim va devoir se charger de l'affaire. Par ailleurs, Jennifer Starke, du bureau du chef de la police, rend visite à Colleen, son amie, pour évaluer les bons résultats de la division. Elle aurait les meilleurs pourcentages d'arrestation de toute la Floride...
S03E04 - La vérité nue
Jim et Carlos mênent l'enquête au sein d'une communauté naturiste. Une femme a été trouvée sans vie par un autre membre du groupe, le corps dissimulé sous un canoë. La victime, tuée de violents coups à la tête, militait activement contre un projet immobilier : cet engagement aurait-il causé sa perte ? De son côté, Jennifer Starke rencontre chacun des membres du département et ne semble pas insensible au charme de Jim. Mais Callie n'a-t-elle pas menti à Jeff sur l'heure de départ de son avion, juste pour passer quelques heures avec Jim ?...
S03E05 - La guerre des restaurants
Alors qu'ils cherchent des tacos, Jim, Carlos et Jennifer découvrent que leur fournisseur préféré a été assassiné. Bien que la recette du jour manque dans la caisse, Jim ne croit pas que cela soit le motif du meurtre. De plus, Tony, la victime, menait bien son affaire, ce qui lui valait la jalousie de nombreux concurrents. Alors que les investigations se poursuivent, l'enquête prend une tournure politique. Jennifer, elle, semble ne pas vouloir quitter Jim d'une semelle. De son côté, Callie participe à la visite des urgences sous la supervision de Miranda...
S03E06 - Apparences trompeuses
Dans un parc, des coureurs découvrent le corps ensanglé d'une femme, poignardée à huit reprises.
S03E07 - Au-dessus des lois
Au cours d'une partie de football, trois adolescents découvrent le cadavre d'une jeune femme. En enquêtant sur le meurtre de celle-ci, une certaine Connie Simpson, Jim et Jennifer remontent jusqu'aux «Sovereign Citizens», de dangereux souverainistes anti-gouvernementaux qui pensent être au-dessus des lois fédérales. Les «Sovereign Citizens» s'attaquent à la brigade criminelle et obtiennent rapidement les suspensions de Carlos et Collin. De son côté, Callie cherche désespérément à remettre la main sur l'enregistrement prouvant le chantage sexuel exercé par son contrôleur fiscal...
S03E08 - Fontaine de jouvence
La propriétaire d'un spa de luxe est retrouvée noyée dans la fontaine de l'établissement. Son mari et sa soeur sont tour à tous soupçonnés par Jim, tandis que l'enquête révèle que la victime était soumise à de fortes doses d'hormones de jeunesse. Pensant piéger son contrôleur fiscal, Callie comprend avec effarement que son plan va se retourner contre elle...
S03E09 - Islandia
Deux biologistes découvrent le corps d'un homme sur une île privée, située au sein de l'archipel Islandia et détenue par un homme vivant seul. La victime, millionnaire suite à un gain à la loterie, avait lancé une procédure pour déshériter son frère, seul parent et unique héritier. L'autopsie révèle une blessure à la tête, et du poison est retrouvé dans son organisme. De son côté, Callie révise pour son examen...
S03E10 - La dernière vague
Alors que des vols et agressions sont à déplorer sur la plage, une touriste est retrouvée morte. L'enquête conduit à un jeune champion de surf. Par ailleurs, tandis que Jennifer dévoile ses sentiments à Jim, ce dernier supporte mal la séparation avec Callie, en plein examens à Atlanta, et doit prendre une décision concernant leur avenir commun...