Sylvia tombe enceinte de l'enfant d'Andy. Fort contraste avec le sort qui attend le fils aîné de Sipowicz, Andy Jr., qui annonce qu'il envisage de rejoindre la police à proximité de Hackensack, dans le New Jersey.
Après avoir témoigné en faveur de Janice, Kelly se retrouve dans le collimateur des boeufs-carottes. Russell aimerait qu'Andy, son 'parrain', déclare à Bobby qu'elle est désormais sobre. James est blessé par une balle, et l'on craint qu'il ne reste paralysé. Donna vient trouver Bobby, et lui fait comprendre qu'elle le trouve beau garçon...
S03E02 - Torah, Torah, Torah
Les détectives discutent avec Mr Wuthrich, après que la fille de ce dernier, Jennifer, ait été retrouvée poignardée dans son lit. Wuthrich raconte qu'il est rentré à la maison le matin même, et a découvert Frank, son fils mentalement retardé, en train de secouer sa soeur dans le but de la réveiller, mais en vain. Wuthrich ajoute que son fils était couvert de sang. Simone et Sipowicz décident d'interroger le jeune homme, qui clame son innocence haut et fort. Mr Wuthrich explique cependant que celui-ci fait souvent preuve d'un comportement très violent...
S03E03 - Une Grande famille
Medavoy travaille avec Lesniak pour tenter de retrouver l'agresseur d'un homme. Russell espère tenir bon face aux coups durs qu'elle traverse, et ne pas sombrer dans l'alcool. Lesniak finit par avouer un secret à Greg...
S03E04 - L'Honneur peut attendre
Sylvia a des nausées, ce qui n'est pas pour mettre Andy dans les meilleures conditions pour aller au travail. La nouvelle concernant Lesniak fait le tour de la brigade. Bientôt, Andy et Bobby se disputent...
S03E05 - Linge sale en famille
Andy est encore réticent à se laisser couper les cheveux par John. Un nouveau détective est placé, quelques temps durant sous les ordres de Fancy, bien qu'il soit dans le même temps sous la surveillance des hautes instances...
S03E06 - Russell connaît son métier
Alors que Greg Medavoy et James Martinez arrêtent un drôle d'oiseau, pris en flagrant délit de vol, Andy doit s'occuper du meurtre d'une femme d'origine indienne, dont le cadavre a été retrouvé dans sa propre voiture...
S03E07 - L'Enlèvement
Sipowicz est dépité lorsque le FBI lui retire l'affaire de l'enlèvement d'un homme d'affaires. Il réussit néanmoins à les prendre de vitesse... Bobby doit faire face à la décrépitude d'un vieil ami atteint de la maladie d'Alzheimer. Medavoy rend visite à Donna, mais le rendez-vous ne se passe pas comme il l'avait prévu...
S03E08 - Double jeu
Un homme vient se livrer de lui-même au commissariat, affirmant être pris de remords après avoir causé la mort d'un jeune garçon. Medavoy, quant à lui, doit prendre en charge un acteur qui vient d'être blessé durant un spectacle...
S03E09 - Fausses pistes
Marie, après s'être à nouveau séparée de Greg Medavoy, vient trouver Donna. Andy, dont l'enquête actuelle concerne une jeune chinoise, refuse à Sylvia de l'accompagner à la clinique pour quelques examens. James et Lesniak ont une conversation sérieuse sur la sexualité de celle-ci...
S03E10 - Frères de sang
Une tuerie a eu lieu lors d'un match de basket-ball. Là-bas, les policiers rencontrent l'organisateur, Fancy, qui se déclare responsable de l'incident dans la mesure où il n'avait informé du match aucune force policière...
S03E11 - La Licorne bleue
La nouvelle enquête d'Andy et Bobby s'annonce des plus ardues : ils doivent enquêter après la découverte des restes d'un cadavre de femme, dont la seule partie intacte laisse entrevoir un tatouage. Greg, lui, entame une partie de poker des plus étranges...
S03E12 - Meurtre à rebondissement
Andy reçoit de la part d'une femme des informations sur un meurtre vieux de 8 ans ! Diane, quant à elle, est bouleversée après qu'une tragédie ait eu lieu chez ses parents, et c'est Bobby qui va découvrir le fin mot sur cette histoire...
S03E13 - Dollars à gogo
James et Adrianne s'apprêtent à passer leur première nuit ensemble, et chacun demande des conseils, à Bobby et Donna. Une femme qui vient de se faire tiré dessus, vient dans l'intention de porter plainte contre la maîtresse de son mari, chirurgien...
S03E14 - Le Cannibale
Sipowicz et Simone sont sur une affaire corsée. Une jeune femme afro-américaine a été retrouvée morte poignardée dans son appartement. Ils ont deux indices : deux noms inscrits sur le mur et la radio allumée sur une station country...
S03E15 - Casse-tête
Andy Jr est de retour, et annonce à son père qu'il vient de prendre une décision importante. James, lui, s'occupe du cas d'une actrice de porno, qui vient lui demander de l'aide. Un enseignant est retrouvé mort dans son appartement, décapité...
S03E16 - Solidarité féminine
Martinez est en désaccord avec les femmes du commissariat à propos d'une affaire de viol sur laquelle il enquête avec Russell. Andy décide de montrer à son fils quelques uns de ses trucs de vieux routard du métier...
S03E17 - Hollie et le poisson-lune
Un transfuge du service des stups est dépêché au 15ème district, mais il s'avère bien vite qu'il n'est guère efficace pour les arrestations, comme semble le constater Diane Russell avec qui il fait équipe. Andy retrouve l'un de ses vieux indics, séropositif...
S03E18 - Un Cercueil pour l'usurier
Des gangsters portent plaintent contre Andy et Bobby, qui auraient commis un cambriolage ! Andy Jr, lui, continue à s'instruire pour devenir un bon policier, tandis que James Martinez et Adrianne Lesniak ont une conversation des plus sérieuse...
S03E19 - Les Bijoux de ma tante
Donna commence à parler de partir, et envisage de déménager en Californie. Andy, toujours aussi râleur, doit emmener Sylvia à l'hôpital, car elle est sur le point d'accoucher. Ce petit garçon s'appellera Théo...
S03E20 - L'Arrêt de mort
Un vol et un homicide amènent Bobby et Andy à l'hôpital. Là, ils découvrent que la victime n'est autre que Andy Jr. Andy souhaite que Bobby traite l'affaire. Mais Diane n'apprécie guère la façon dont il mène l'enquête. Peu après, l'arme du meurtre est découverte mais la piste reste bien floue...
S03E21 - Hors limites
Andy devient de plus en plus associable depuis qu'il s'est remis à boire. Il se dispute avec Sylvia, et Fancy ne veut pas qu'il travaille dans cet état. Pire, il agresse des jeunes au coin d'une rue, mais il se fait tabasser, et on lui vole son revolver...
S03E22 - Cas de conscience
Alors que Bobby et Diane sont sur le point de partir en vacances, on baptise Théo, le fils d'Andy et de Sylvia. Greg Medavoy, quant à lui, fait connaissance avec une demoiselle travaillant pour la répression du banditisme...