Lena, Mahad et leur mère Mila vivent en paix sur le bloc de Babylonia. Mila tente de cacher les pouvoirs magiques de sa fille Lena et éviter qu'elle ne soit enrôlée par la Sphère. Mais un jour, un incident survient. Lena est obligée de se servir de ses pouvoirs et Mila va tout faire pour la protéger.
S01E02 - L'Aube d'un nouveau jour – 2ème partie
Les enfants de Mila sont recueillis par un Vecteur qui veillera désormais sur eux. Mahad et Lena en apprennent plus sur leur père, un héros de la résistance, qu'ils croyaient disparus depuis longtemps. Ils embarquent sur un vaisseau lui ayant appartenu.
S01E03 - Le Maître des airs
Maître Hailong Zalo, un ami de Vecteur, apporte un message de Mila. C'est peut-être un indice pour la retrouver...Mahad et Lena se rendent dans la zone des blocs de Ningxia. Mais la Sphère les attend pour les capturer. En prison, ils vont rencontrer un allié de choix...
S01E04 - Mogura
Une grande sècheresse s'est abattue sur Puerto Angel. La seule solution : investir une station d'épuration abandonnée par la Sphère. Mais quand les Pirates arrivent sur place, ils découvrent que la station est occupée par un terrible robot conçu pour détecter l'eau et l'extraire: le Mogura. Mais le corps humain est composé à 85% d'eau.
S01E05 - L'Archipel des tempêtes
En libérant un convoi de prisonniers, Cortes et ses Pirates ramènent un ancien convoyeur à Puerto Angel. Il prétend connaître l'emplacement de la forteresse où est retenue Mila. Mahad et Lena, contre l'avis de Cortes qui se méfie du convoyeur, vont quand même s'y rendre et découvrir le décor fascinant de l'ancienne ville de Paris. Mais des envoyés de la Sphère les attendent pour les enlever...
S01E06 - L'Oeil du cyclone
Un ouragan menace un secteur de Skyland. Tandis que l'équipage de Cortes essaie de sauver les réfugiés isolés, Mahad et Dalhia, le bras droit de Cortes, se retrouvent coincés sur un bloc de glace qui se dirige droit sur Puerto Angel, l'île des pirates. Il ne reste qu'une seule issue possible: faire exploser le bloc, mais nos deux héros ne pourront pas s'enfuir avant l'explosion...
S01E07 - La Mutinerie
Lors d'une patrouille, le vaisseau de Cortes intercepte un patrouilleur à la dérive. Une fois à bord, ils réalisent que les "parents" étaient en fait des agents de la Sphère qui escortent une jeune Seijin, petite fillle dotée de pouvoirs, emmenée de force au Tutorat. Les deux tuteurs prennent l'avantage sur Cortes et son équipage, mais Lena et Mahad leur échappent. Il ne leur reste plus beaucoup de temps pour sauver leurs amis.
S01E08 - Manipulation
Un phénomène solaire rend les pouvoirs Seijin imprévisibles. Oslo, un Seijin à la solde de la Sphère arrive à prendre le contrôle de Dahlia, le bras droit de Cortes. Il s'arrange pour mettre en cause Lena afin que la population la soupçonne. Elle se réfugie chez le Vecteur, le grand Sage de Skyland. Oslo a alors le champ libre pour télécharger les données de Puerto Angel.
S01E09 - Roi d'un jour
Tout allait bien pour Mahad le jour où Cortes l'avait nommé "pirate en chef" pendant son absence, jusqu'à ce que la sphère localise le bloc et décide de s'y rendre. Pour Mahad, Lena et Dahlia, le rêve tourne vite au cauchemar...
S01E10 - Roches rouges
Alors qu'ils ont intercepté un appel de leur père Marcus Farrel, Mahad et Lena embarquent en direction de l'émetteur, aidés par Oslo qui prend en filature la transmission. Mais après une rapide bataille, tous s'écrasent sur un bloc désert. Blessé, Oslo ne peut plus utiliser ses pouvoirs... Toujours à la recherche de l'appel, ils sont attaqués par un monstre invisible...
S01E11 - Babylonia
Alors qu'elle est en train de ranger ses affaires personnelles, Lena reçoit un message télépathique de sa mère. Toute contente, elle se rend alors avec Mahad et Dahlia sur le bloc de Babylonia, dans l'espoir d'intercepter de nouveaux messages. Lorsqu'ils arrivent sur Babylonia, Mahas retrouve ses deux amis Shoomday et Hanako.
S01E12 - Les liens du sang
Le grand-père de Cheng, Tibald Jaïd, est le principal concepteur des armes de la Sphère. Pour retrouver et récupérer son petit-fils, il envoie un patrouilleur téléguidé vers Puerto Angel. Cheng, qui découvre qu'il a un grand-père, décide d'aller à sa rencontre en plein territoire ennemi. Une réunion familiale gâchée au final par l'arrivée de Diwan qui s'empare de Cheng.
S01E13 - Max
Au cours d'une expédition sur Brooklyn, Mahad, Lena et Cheng croisent un étrange personnage et sa fille, pourchassés par la Sphère. Une fois à Puerto Angel, le Vecteur identifie l'homme comme étant un immense scientifique dont les recherches sur l'eau sont d'une importance capitale pour la Sphère. Mahad est plus intéressé par la jeune Astrid, qui lui révèle que Max n'est absolument pas le scientifique qu'il prétend être.