David a fui Toronto pour affronter sa culpabilité. Arrivé en Chine, il est enlevé par des soldats chinois qui le conduise à un camp de quarantaine. Là, le général Hung lui demande d'aider une équipe de scientifiques locaux à identifier une mystérieuse maladie qui fait de nombreux morts...
S02E02 - Attaque mutante
David revient chez NORBAC, à la demande de Caroline, afin d'aider l'équipe à trouver un traitement personnalisé.
S02E03 - Médicament miracle
Carlos, David et Bob essayent de trouver la formule pharmaceutique qui va permettre de sauver le petit Richard. Pendant ce temps, Mayko et Simon enquêtent sur la maladie du Prion.
S02E04 - Réchauffement climatique
Bob et David se trouvent à New York, où Bob doit tenir une conférence sur le réchauffement climatique. Alors qu'ils se promènent, David est victime d'un vol à l'arraché.
S02E05 - Mauvaise nouvelle
Branle-bas de combat au Norbac: Jill a utilisé pour maintenir en vie les cellules pancréatiques, une lignée de cellules souches embryonnaires, d'origine sud-coréenne, non approuvée par Washington.
S02E06 - Voyage à la Havane
David et Carlos se rendent à Cuba afin d'enquêter sur une mystérieuse épidémie qui décime des champs d'orangers à Miami. On craint une attaque bioterroriste.
S02E07 - Parle-lui
Salvador Charringa possède des plantations d'agrumes en Floride et à la Havane qui sont toutes contaminées. A Cuba, David et Carlos découvrent une bactérie identique à celle de Floride, alors qu'elle a été éradiquée depuis quinze ans. S'agit-il de bioterrorisme?
S02E08 - Brumes mexicaines
Le nuage toxique au dessus du mont Popocatepl, qui mélange pollution, cendres et produits chimiques nocifs, continue sa progression vers Mexico City.
S02E09 - En souvenir d'Harlan
L'équipe enquête sur une curieuse épidémie de suicides, alors que David essaie de sortir Owen de l'enfer de la drogue.
S02E10 - Le sauvage et l'innocent
Les dossiers de recherche de H.Sendak, que David avait récupéré ont mystérieusement disparu. David et Carlos se rendent en Arkansas, où le taux de suicide ne cesse d'augmenter.
S02E11 - Un étrange virus
David est chargé d'enquêter sur un virus qui semblerait attaquer des militaires susceptibles d'être envoyés en Irak.
S02E12 - Léthargica
Le Norbac vient de constater qu'une garnison entière de la garde nationale est affectée par un virus que l'on n'avait pas vu depuis au moins cent ans.
S02E13 - La fin ?
Jill se remet du virus après qu'on lui ait injecté l'antidote, mais elle n'est pas encore totalement guérie. En effet, les gardes qui ont reçu l'antidote souffrent d'une infection encore plus dangereuse...