Jo McDonagh, nouvelle recrue de la Commission d'enquête spéciale de l'armée britannique, fait face à un premier cas délicat : un caporal a tenté de se suicider au volant d'une voiture qui appartenait à la femme disparue d'un capitaine de l'armée.
S01E02 - Une coupable idéale
Au volant d'un camion transportant des soldats, Sam Walters, épuisé, n'arrive pas à éviter une voiture, et meurt avec ses soldats dans l'explosion des deux véhicules. La police allemande se joint à l'enquête de la SIB, afin de déterminer si l'explosion est bel et bien le fruit d'un accident
S01E03 - Détournement d'armes
Burns et Howard enquêtent sur la mort d'un policier allemand abattu par une arme militaire lors du braquage d'une banque. De leur côté, Jo et Roper enquêtent sur le suicide du soldat Luke Gemmill, chauffeur du lieutenant-colonel John Cosgrove. Il se pourrait que la mort de ce dernier soit en fait un meurtre
S01E04 - Le prix de l'honneur
En plein exercice de simulation de guerre chimique à la base de Derbyshire, la journaliste chargée de couvrir l'évènement, Theresa Brock, est portée disparue alors que le capitaine Glover l'avait renvoyée au campement. Très vite, la SIB découvre que la journaliste s'était infiltrée sous une fausse identité et qu'elle appartenait à un groupuscule terroriste pakistanais
S01E05 - Les ombres du passé
Un agent des Services Secrets signale au Capitaine Glover qu'un indic de l'IRA a dévoilé des informations sur son groupe à la presse. Comme cet informateur était en contact avec lui, Glover craint des représailles et cherche à protéger sa famille. La SIB, de son côté, est appelée à enquêter sur la disparition d'un lieutenant
S01E06 - Rebellion
Le lieutenant-colonel Fox est, à plusieurs reprises, victime des farces d'un inconnu. Lorsque sa voiture est subtilisée dans le parking de son bureau, Jo et Rover suspectent le soldat Mc Ewan qui a mystérieusement disparu. Burns, lui, prend contact avec un de ses anciens amis sur le point d'être juger en cour martiale