Les Cordier père et fils, le commissaire et le juge d'instruction, interrogent un jeune toxicomane qui a cambriolé une officine, lorsque paraît l'avocat commis d'office. Celui-ci n'est autre que Joseph Cohen, un vieil ami du commissaire, perdu de vue depuis vingt ans. Un repas fête ces retrouvailles. Fragilisé par la mort accidentelle de sa femme, Joseph a sombré dans l'alcool et perdu toute crédibilité professionnelle. Cathy, sa fille, plaît beaucoup à Bruno. Mais pourquoi diable se trouble-t-elle lorsque le jeune juge prie ses convives d'excuser son retard en racontant qu'il a été retenu par un crime horrible : l'assassinat à coups de ciseaux d'un restaurateur parisien, Richard Pavail ?...
S05E02 - Comité d'accueil
Branle-bas de combat chez les Cordier, engagés sur tous les fronts. Bruno, le juge, a en effet confié à son père, le commissaire, un lourd dossier, l'enquête sur l'attaque d'un fourgon de la préfecture de police par une bande de malfaiteurs. Myriam, la fille, tente de remonter une filière de passeurs qui «importe» de la main-d'oeuvre clandestine en provenance des pays de l'Est. Cordier père découvre rapidement que le commissaire Jansen, son homologue de la préfecture de police, a eu maille à partir avec sa hiérarchie pour avoir refusé d'étouffer une affaire douteuse. Myriam, qui mêle vie privée et vie professionnelle, devient la maîtresse d'un jeune émigré roumain. Elle passe une nuit dans ses bras puis, au matin, ne monte dans sa voiture que pour en sortir aussitôt, entre deux gendarmes, des paquets d'héroïne dans les poches. Elle a beau crier à la machination, elle n'en file pas moins directement en prison...
S05E03 - Le Crime d'à côté
Bruno Cordier reproche vertement à sa soeur Myriam de s'incruster dans son appartement quand un coup de feu éclate dans l'immeuble. Le jeune juge se précipite dans le logement mitoyen et se retrouve nez à nez avec un forcené qui vient de blesser grièvement son voisin, Magnien, un policier, et qui retourne son arme vers lui, le touchant à la jambe. Les forces de l'ordre investissent l'immeuble et se disposent à donner l'assaut quand le commissaire Cordier, arrivé sur les lieux, parvient à ajourner l'opération. Cordier, qui craint le pire, préfère négocier et parvient à calmer le fou furieux, qui se contente de prendre le juge en otage. Il reste encore à obtenir la libération du magistrat...
S05E04 - L'adieu au drapeau
Pascal Gillet et Julie Ledantec, deux lieutenants d'un régiment d'élite de l'armée de terre, reviennent d'une permission en train. Leur couple bat de l'aile. Comme si cela ne suffisait pas, leur régiment doit être dissous dans dix jours. A la suite d'une querelle, Julie quitte le compartiment. A l'arrivée du train, Gillet est retrouvé mort, une balle dans la tête, une arme à la main. Bruno Cordier confie l'affaire à son père. Comme le prévoit la procédure, il lui adjoint un officier de gendarmerie, le commandant Chauvat. Pour les Cordier, Gillet s'est suicidé, cela ne fait aucun doute. Pendant ce temps, le célèbre capitaine Broca apprend à Julie la mort de son ami. La jeune femme s'effondre. Elle se sent responsable de ce décès...
S05E05 - La tour de Jade
Le juge Bruno Cordier a rendez-vous avec un policier corrompu, Darmont, dans un restaurant, «La Tour de Jade», situé en plein coeur du quartier chinois. La confrontation entre les deux hommes, qui en savent long l'un sur l'autre, est dramatique. Le juge n'ignore rien, en effet, des activités de Darmont, grassement entretenu par la pègre chinoise pour l'avertir des différentes descentes de police. De son côté, Darmont demande à Cordier de modérer l'ardeur de son enquête sur la corruption des services de police, faute de quoi il sera contraint de révéler au grand jour sa liaison avec une jeune prostituée chinoise, Meiling, qu'il a lui-même choisie et payée pour qu'elle compromette le juge. Si Cordier s'obstine, Meiling pourrait bien y laisser la vie...
S05E06 - Le petit frère
Marco, un jeune truand repenti, est contraint par un caïd local, Lucas, de l'accompagner dans un hold-up hasardeux. En réalité, les deux hommes se jettent dans la gueule du loup. L'équipe du commissaire Cordier les attend dans la bijouterie. Marco est grièvement blessé sans que Lucas ne lève le petit doigt pour le sauver. Petit Louis, le frère de la victime, un gamin de 12 ans, a tout vu. Il se procure une arme, échappe à la surveillance de la police et se lance sur la piste de Lucas, en fuite. Il parvient à retrouver le truand avant la police et tire sur lui. Lucas est blessé. Il s'empare de Petit Louis et le prend en otage. Pendant ce temps, Da Silva, le père de Marco et de Petit Louis, de retour après une trop longue absence, tente de venir en aide à son fils...
S05E07 - Boulot de flic
Cordier est chargé par ses supérieurs de se rendre sur les lieux d'un hold-up, dans un centre commercial. La bijouterie qui a été cambriolée n'en est pas à sa première agression. Cordier rencontre l'inspecteur Vannier, chargé de l'enquête. A peine a-t-il eu le temps de prendre connaissance des circonstances de l'effraction qu'il doit remettre ses investigations à plus tard. On vient en effet de découvrir le corps d'une jeune fille, assassinée dans un square près d'une gare de banlieue. On trouve sur elle un pendentif portant l'inscription «Vanessa». Il semble que ce meurtre ne soit pas un crime isolé, puisqu'une agression du même type a été signalée dans le secteur quelques mois plus tôt. Les enquêteurs découvrent que la victime, qui n'avait que 17 ans, entretenait une liaison avec un homme de 45 ans...
S05E08 - L'oeil du cyclope
Myriam, la fille des Cordier, accuse Raymond Nora, le directeur d'un laboratoire de recherche, d'avoir profité de sa position pour détourner des fonds. Elle rend publique ses affirmations dans un article qui fait grand bruit. Peu après, elle apprend que Nora s'est suicidé. Myriam s'interroge sur la validité de son attaque et se remémore les événements qui l'ont conduite à conclure à l'indignité de Nora. Tout d'abord, la mort suspecte de Gilles Durand, collaborateur de Nora. Puis l'apparition d'un mystérieux informateur, Isis, qui la contacte sur Internet. Au cours d'un rendez-vous, l'homme lui remet des documents compromettant Nora...