S11E01 - Les bonnes actions résultent parfois de méfaits et vice-versa
Un étang qui doit être vidé. Pendant ce temps, l'arme de destruction massive continue de se charger…
S11E02 - Les lapins sautent au clair de lune
Kagura sent une aura étrange, mêlée à la frénésie de la bataille, et décide d'aller voir ce que c'est, seule. Elle tombera nez à nez avec des Yato et la troupe des Harusame vient à son secours.
S11E03 - Faisons de ce monde inintéressant un endroit fascinant
Utsuro est de retour et désormais prêt à contrer le marteau divin ardent grâce à l'altana de la Terre.
S11E04 - Agir de manière inhabituelle entraîne des conséquences inhabituelles
Le combat fait rage à bord de l'Amenotori. Takasugi et ses camarades empêcheront-ils Enshô d'arriver à ses fins ?
S11E05 - Les nombreux rois
C'est l'heure des derniers règlements de comptes entre les protagonistes. Pendant ce temps, sur les autres champs de bataille, tout le monde tente de s'organiser.
S11E06 - Le chômage ne se laisse teindre par rien ni personne
Umibôzu a réussi à rassembler les cristaux d'altana des planètes, afin de rendre Utsuro mortel et le neutraliser pour de bon.
S11E07 - La carte maîtresse se joue à la fin
Il est enfin temps de tenter le tout pour le tout contre Utsuro.
S11E08 - La créature appelée être humain
Utsuro avait tout prévu pour subjuguer les humains, pour ainsi pouvoir éradiquer leur espèce. Toutefois, il n'avait pas anticipé qu'ils se relèveraient sans relâche…
S11E09 - Enseigne
Deux ans après la guerre, Edo est toujours en train de se reconstruire. Shinpachi a pris les rênes de l'Agence à tout faire, en l'absence de Gintoki et Kagura.
S11E10 - Fantôme
Donald Zurump, le premier Premier ministre du Japon, n'est autre que Katsura ! Mais dès son entrée en scène, on attentera à sa vie.
S11E11 - Deux ans pour une fille équivaut à dix ans pour un homme
Le Shinsengumi s'est bel et bien dissous, mais Okita, qui ne s'est pas véritablement fait seppuku, et ses camarades font désormais partie d'une organisation, vouée à anéantir le gouvernement actuel.
S11E12 - Salut
À bord du navire de Takasugi, les deux disciples de Shôyô discutent de ce qu'ils ont fait pour leur maître, ces deux dernières années.
S11E13 - Kuwah
Hijikata et Yamazaki prennent en filature Gintoki et Takasugi. Même si le policier tente de tempérer son robot multifonctions, ce dernier enchaîne les bêtises !
S11E14 - Même pour un méchant, il y a des choses à éviter
Quoi ?! La série est condamnée à devoir prendre fin au beau milieu d'un arc ? Gintoki s'autoproclame juge, et le procès sur l'arnaque de la fin de l'animé Gintama est… officiellement ouvert !