Année 1614, ère d'Edo, deux clans ninja légendaires Koga et Iga, ennemis depuis 400 ans s'affronte, chacun supportant un des deux fils du shogun Tokugawa Ieyasu. En effet, celui-ci a décidé que celui de ses deux fils qui lui succédera sera désigné par l'issue de la confrontation des deux clans.
Les chefs de deux clans de guerriers ninja, Iga et Kouga, sont convoqués à Sunpu pour lancer une importante compétition entre les deux.
S01E02 - Deuxième mouvement
Oboro et Gennosuke ont un rendez-vous. La lutte entre les deux clans commence en essayant d'obtenir la "copie Iga" du document qui révèle les détails du tournoi des Ninja.
S01E03 - Cruelles nuées d'insectes
Le drame s'intensifie alors que le clan Iga tente de déjouer ses adversaires en attaquant à la fois Kazamachi Shôgen, qui possède la copie du parchemin.
S01E04 - Les murs maléfiques de la nuit
Un agréable dîner a lieu avant que d'autres Iga n'entendent parler de la guerre.
S01E05 - Rites ninja
Les Kouga commencent à s'inquiéter de l'absence de Gennosuke, et des mesures sont prises pour étudier la configuration du terrain.
S01E06 - Larmes d'amour
Lors de leur voyage de retour vers les exploitations du clan Iga, des primes inattendues sont découvertes dans la nature.
S01E07 - Contact infernal
Gennosuke se méfie à mesure que l'hostilité augmente, tandis que l'autre captif Kouga prend des décisions désastreuses.
S01E08 - Impitoyable nuage de sang
Le temps est venu de s'endurcir le cœur, de mettre l'espoir de côté. Les frères et soeurs cherchent à se réunir.
S01E09 - Triste pluie incessante
Avec le parchemin secret désormais en possession de Gennosuke, la tromperie élaborée par les Iga prend fin.
S01E10 - Ordres du maître
Lord Ieyasu et les nobles passent en revue le carnage à distance, comptant les morts après seulement deux jours depuis la rupture de la paix.
S01E11 - Obstacles sans espoir
La roue du destin a commencé à tourner, alors que l'histoire semble se répéter. Appelée à rester unie à son clan, contre les Kouga et son bien-aimé Gennosuke, Oboro sacrifie leur arme la plus précieuse.
S01E12 - Réminiscences
Lorsque le défi lancé par Gennosuke est accepté, les deux clans prennent la route. Mais la trahison et la mort les suivent.
S01E13 - La danse effrénée des papillons
Les amants se retrouvent à l'ombre dans la nuit, alors que les coups de la guerre se poursuivent sans relâche.
S01E14 - Mort subite dans le détroit
Les mots du passé hantent Gennosuke, et Oboro est convaincu que sa vie se terminera entre ses mains.
S01E15 - Mort sur les flots
La haine du passé pousse à l'imprudence, et lorsque deux ennemis sont pris au piège, l'un ne peut pas échapper à l'autre.
S01E16 - Souvenirs éphémères
A une époque plus simple, bien avant les machinations politiques et la dissolution du pacte de non hostilité, un plan a été mis en place pour assurer une paix durable entre les Kouga et les Iga.
S01E17 - Errance dans les ténèbres
Les Kouga se pressent vers le château de Sunpu. Une fausse direction sous la forme d'un faucon et un affrontement dans la nuit révèlent les véritables intentions de Gennosuke.
S01E18 - L'aube des ténèbres
La mort se tient sur le chemin des Kouga, attendant avec un souffle appâté, silencieuse dans la brise de la nuit. Le sacrifice du mentor assure la survie de l'élève.
S01E19 - Complot d'une femme sanguinaire
De fausses voix dans la nuit jouent au mensonge et à la tromperie, conduisant une personne aveugle à une mort inévitable.
S01E20 - Miséricorde
Sur les rives d'un fleuve, un laissé pour mort est de nouveau ressuscité. Ayant enfin appris la vérité qu'il cherchait à découvrir, Gennosuke est résigné face à cette guerre qui n'a jamais été la leur.
S01E21 - Kagerô, la fascinante meurtrière
Le secret de Tenzen est enfin révélé, et prouve la mort d'un Kouga déguisé. Alors que les forces de Lady Ofuku apportent force et protection aux deux survivants d'Iga, ils continuent leur chemin vers le château de Sunpu.
S01E22 - Lamentations
Avec Kagero en captivité, Oboro lance un défi public, cherchant à faire sortir Gennosuke pour l'affronter une dernière fois.
S01E23 - Désir d'étreinte
Gennosuke coupe enfin le serpent, celui qui a alimenté l'inimitié entre les Kouga et les Iga pendant deux siècles.
S01E24 - Retrouvailles dans la mort
Ramenés sur les lieux mêmes où tout a commencé, Gennosuke et Oboro s'affrontent sur le champ de bataille.