Un individu ou une organisation en veut aux agents du NCIS. Sam et Callen sont constamment en danger de mort. Hetty, elle, a bien faillir être victime d'un rapt. Le département de la Justice débarque à Los Angeles et fouille dans les dossiers du NCIS. Les faits et gestes de chacun semblent être épiés et connus. Y aurait-il une taupe au sein du pôle ? Les incidents inter-agences se multiplient. D'anciennes relations refont surface plus ou moins volontairement, un sosie est même signalé. Au sein de ce tourbillon, un tout nouveau couple connaît sa première dispute...
Callen et Sam sont piégés dans un sous-marin utilisé par des terroristes pour une mission suicide contre un porte-avion nucléaire américain. Toute l'équipe est mobilisée pour localiser l'appareil et sauver les agents avant que le submersible ne soit détruit par la Navy…
S06E02 - Praesidium (1/3)
Sam et Callen sont extraits d'une mission d'infiltration pour enquêter sur le meurtre d'un programmateur informatique ayant travaillé sur la cyber-insécurité du NCIS. Par ailleurs, à Washington, Hetty doit répondre aux questions du comité de supervision sur la mission de Kensi en Afghanistan tandis qu'à Los Angeles le NCIS voit débarquer le département de la justice, venu enquêter sur l'institution et ses agents…
S06E03 - Praesidium (2/3)
Tous les agents du NCIS sont convoqués à 6h du matin suite à une tentative de kidnapping chez Hetty, alors que celle-ci se trouve toujours à Washington pour répondre des accusations dont elle fait l'objet. Alors qu'ils tentent d'identifier ceux qui s'en prennent à leur supérieure, Ava Wallace et ses collègues du département de la justice traquent sans relâche Callen et son équipe pour les interroger…
S06E04 - Praesidium (3/3)
Le NCIS a identifié celui qui traque Hetty, Mattias Draeger, et Callen engage une véritable chasse à l'homme, allant jusqu'à mettre à disposition une récompense de 236 000 dollars provenant de ses propres fonds. Toujours retenue à Washington, Hetty s'échappe pour rejoindre son équipe, tandis que Nell reçoit l'aide psychologique de Nate Getz après avoir abattu un homme sur le terrain…
S06E05 - Caisse noire
Callen et Sam partent en mission à Tijuana retrouver un employé du département de la Défense, rescapé d'une fusillade dans des locaux dédiés au financement des opérations secrètes. À Los Angeles, le reste de l'équipe découvre que l'homme avait signalé un détournement de fonds de grande ampleur…
S06E06 - Imposture
Sam est arrêté par le FBI pour le meurtre d'une jeune femme qu'il affirme ne pas connaître. Alors que l'ADN de l'agent a été retrouvé sur la victime, Callen et Granger essayent d'obtenir les éléments du dossier tandis que Kensi et Deeks creusent le passé de la victime. L'enquête va mener le NCIS vers un ancien membre des Marines qui s'avère être le sosie de Sam…
S06E07 - Leipei
Callen et son équipe enquêtent sur le meurtre d'un homme via un drone télécommandé et découvrent que la victime appartenait à un réseau terroriste grec avant de bénéficier de la protection des témoins. Leur investigation permet alors de mettre à jour un projet d'attaque de plus grande ampleur. Par ailleurs, Hetty et Granger tentent de débusquer une taupe au sein du NCIS Los Angeles…
S06E08 - Invisible
Le NCIS enquête sur la mort d'un ancien Marine qui se faisait passer pour un SDF. L'homme, qui avait participé à des opérations secrètes pour la CIA, était un expert de l'infiltration et semblait désormais lié à un cartel mexicain. Pour éviter de nouveaux incidents inter-agences avec Hetty, Granger reprend directement contact avec un ancien collaborateur de la CIA…
S06E09 - Une taupe parmi nous
La présence d'une taupe au sein du NCIS se confirme lorsque Granger échappe de peu à la mort après avoir été empoisonné. Hetty déclenche le confinement des bureaux et Nell dresse une liste de 7 suspects, parmi lesquels figure son acolyte Eric…
S06E10 - Autorité paternelle
Une explosion dans la propriété d'un agent de la CIA, mariée à un Marine, déclenche une enquête du NCIS. Des explosions similaires ayant entraîné la mort de deux autres Marines ont pour point commun que les enfants des victimes fréquentaient la même école militaire…
S06E11 - Tapis
À l'approche de Noël, le NCIS enquête sur le cambriolage et l'incendie survenus dans une entreprise de cyber-sécurité spécialisée dans les antivirus. Callen doit rester à l'écart parce que sa petite amie Joëlle, qui ne connaît pas son vrai métier, est l'un des témoins principaux…
S06E12 - Piège de cristal
Callen travaille sous couverture au service courrier d'une entreprise pour enquêter sur un trafiquant d'armes au moment où une prise d'otages éclate. Les terroristes, parmi les dangereux dans le pays, ont piégé tout le bâtiment et réclament la libération de 100 prisonniers détenus à Guantanamo...
S06E13 - Le Sens du devoir
Le consulat américain de Tunisie est attaqué par des djihadistes. Si l'ambassadrice a pu être sauvée, un Marine est tué lors de l'assaut. Sam et Callen se rendent sur place en mission top secrète afin de scanner la scène de crime pour la reproduire en 3D à Los Angeles. Au fur et à mesure de leur enquête, les agents du NCIS se demandent si l'ambassadrice était vraiment la cible de cette attaque…
S06E14 - Le Bout du tunnel
Soupçonnant une tentative d'attaque bactériologique sur le quartier général des Marines à la frontière mexicaine, Sam et Callen partent enquêter sous couverture à Tijuana. Ils coopèrent avec l'agent local Paola Fuentes tandis que Kensi et Deeks découvrent l'existence de tunnels souterrains utilisés par les cartels pour passer du Mexique aux États-Unis…
S06E15 - L'Arbre qui cache la forêt...
Prévenus par un appel anonyme de la disparition d'un analyste de la NSA, Sam et Callen doivent rencontrer un informateur dans un lieu isolé qui s'avère être un guet-apens… Sans nouvelles d'eux, les agents du NCIS se lancent à leur recherche alors que Granger a rendez-vous le jour-même avec un informateur à propos d'une cellule de Daesh à Los Angeles.
S06E16 - Date d'expiration
Lors d'une mission de routine où le NCIS doit récupérer Ella Deshai, agent indien spécialisée dans le nucléaire et sur le point d'être intégrée à la CIA, Sam est très gravement blessé par un tir de sniper. Callen doit coopérer avec un Gurkha, soldat indien chargée de la ramener en Inde, pour identifier les auteurs du tir et déterminer si Ella est un agent double. Au matin de cette affaire, Kensi et Deeks vivent leur première dispute sur l'évolution de leur couple…
S06E17 - Savoir-faire
Trois militaires de l'armée nationale afghane sont invités à Los Angeles par le gouvernement pour suivre une formation au sein de la DEA et ainsi lutter contre le trafic de drogue dans leur pays. L'un d'entre eux se fait poignarder tandis que les deux autres disparaissent. Le NCIS doit les retrouver et déterminer si la menace vient d'une taupe à la DEA ou des révolutionnaires afghans…
S06E18 - Les Ombres
Une opération d'infiltration du FBI tourne au drame lorsque 3 agents sont tués dans l'explosion d'un convoi transportant du C4 provenant de la Navy. Dans le cadre de cette enquête, en collaboration avec l'agent Alison Conway du FBI, Hetty redistribue les équipes au sein du NCIS et sépare Kensi et Deeks, tous deux ayant été photographiés par une mystérieuse femme…
S06E19 - La Beauté du geste
Le tir d'un missile expérimental est détourné de son objectif et termine sa course sur un bateau de plaisance. Chargé d'identifier les auteurs du piratage du système de guidage, le NCIS collabore avec une jeune experte en sécurité des réseaux informatiques, engagée par Hetty pour infiltrer un petit groupe de hackers.
S06E20 - La Rage au ventre
Callen infiltre en prison un gang de suprémacistes blancs dont le leader est suspecté d'avoir volé du matériel nucléaire de la Navy. L'homme ayant été libéré, Sam et Granger organisent l'évasion de Callen tandis que Kensi entre dans la peau de sa petite amie motarde. Callen est touché par l'un des membres, qui lui rappelle sa jeunesse délinquante avant qu'Hetty ne le prenne sous son aile…
S06E21 - Les Malheurs d'Arkady
Arkady Kolcheck, ancien membre du KGB et vieille connaissance du NCIS, échappe de peu à une tentative de meurtre. Pour le protéger et identifier ses ennemis, les agents ont besoin de réponses, notamment à propos d'un mystérieux yacht utilisé pour le transport de marchandise, mais Arkady refuse de dévoiler ses secrets. Par ailleurs, Deeks semble préoccupé par l'enquête des affaires internes dont il est l'objet…
S06E22 - Tueur sous influence
Un ancien sniper des Marines s'échappe de l'hôpital militaire dans lequel il était soigné pour syndrome post-traumatique. Lorsque les agents découvrent des médicaments non-prescrits cachés dans sa chambre, le NCIS soupçonne une action terroriste consistant à former des tueurs sous influence…
S06E23 - Kolcheck, A
Arkady Kolcheck, l'ami et informateur de Callen mêlé à la disparition d'un pétrolier, refait surface lorsque l'équipage du navire est retrouvé en mer. Le NCIS cherche à découvrir qui a pu prendre le contrôle du super-tanker. Au contact de Kolcheck, Callen tente d'en apprendre d'avantage sur le rôle exact de son père à l'époque où il aidait des réfugiés à fuir la Russie…
S06E24 - Chernoff, K
Dans l'affaire du pétrolier volé, Callen, Sam, Deeks et Kensi sont envoyés à Moscou pour identifier les acheteurs et retrouver la fille d'Arkady Kolcheck, Anna, qui a été kidnappée. Callen apprend que son père, Nikita Reznikov, envoyé au goulag en 1974 pour avoir aidé des dissidents russes à fuir le pays, aurait pourtant continué ses activités jusqu'en 1988 sous une autre identité…