Les Tortues rencontrent pour la première fois April O'Neil. Splinter lui explique son origine et celle des Tortues.
S01E02 - L'arrivée de Shredder
S01E03 - A propos des Rats
Le scientifique Baxter Stockman a créé un robot chasseur de rats: Mouser. Shredder développe alors une grande production de ces robots pour se débarasser de son ennemi Splinter.
S01E04 - Hot-Rodding Teenagers from Dimension X
Grâce à l'équipement de Baxter, les Tortues se construisent un véhicule armé pour affronter Shredder. De son côté, Shredder ouvre un portail dimensionel dans l'espoir de récupérer de puissantes armes.