A la recherche d'un spécimen extraterrestre recueilli par les Humains, les Tlak'kahn envahissent Stargate Command, obligeant le vétéran Gus Bonner et une équipe composée de quatre jeunes recrues et de l'alien Ec'co à fuir par la Porte des étoiles...
S01E02 - Rencontre
Toujours en fuite et dans l'incapacité de joindre Stargate Command, l'équipe débarque sur une planète dont les habitants sont victimes d'une mystérieuse maladie, peut-être liée à une précédente mission de Bonner et de son escouade. Bientôt, la planète est envahie par les Tlak'kahn, toujours à la recherche de la chrysalide alien... et de Bonner, qu'ils veulent éliminer.
S01E03 - Le meilleur des Mondes
L'équipe tombe sur un "repère" susceptible de la guider vers la planète-mère des Ancêtres. Harrison devient l'esclave d'une extraterrestre repoussante...
S01E04 - Retour aux sources
Gus et Ec'co se rendent sur la planète où vit la mère d'Ec'co, afin d'en savoir plus sur les Tlak'Khan. Ec'co est surpris de voir que, sur la planète de sa mère, ses congénères le traitent comme un métis...
S01E05 - Le mentor
L'officier Gus Bonner et les aspirants rencontrent un ancien chef d'escouade Stargate dont le style avait inspiré le jeune homme. Mais celui-ci est stupéfait lorsque son ami le livre à Da'Kyll...
S01E06 - Eaux troubles
Quand Gus et les aspirants sont précipités sur une planète pratiquement noyée sous les eaux, Harrison ne peut s'empêcher de vanter ses exploits de nageur olympique...
S01E07 - Phobie
Lors de l'exploration d'un nouveau monde, Stacey blesse par mégarde un alien dépourvu de mauvaises intentions.
S01E08 - Charmante compagnie
Seattle adopte un animal alien, mais les choses se gâtent quand le lendemain matin, la gentille créature se transforme en un colosse de cent kilos, pour devenir bruyant et chahuteur..
S01E09 - Révélations
Quand l'équipe arrive sur une planète habitée par des aliens qui ont le don de se métamorphoser, Gus et ses acolytes s'aperçoivent que seule la personnalité de chacun permet de distinguer les vrais membres de l'équipe.
S01E10 - L'appât du gain
S01E11 - Le prix de la pierre
Après avoir perdu un combat, Stacey se tourne vers les pierres de Mandros pour accroître sa force et son adresse.
S01E12 - Initiation
S01E13 - Inventions
S01E14 - L'alliance
S01E15 - L'amalgame
L'équipage rencontre les habitants d'une planète se battant contre des "envahisseurs". Ils se joignent immédiatement au combat sans savoir que ce peuple indésirable est pacifiste.
S01E16 - Apprentissage
Ec'co s'aperçoit qu'une comète fonce droit vers la planète...
S01E17 - L'impasse
S01E18 - Le remède
Gus et les aspirants rencontrent le docteur Keri Mason, une vieille amie, à un colloque de scientifiques. Le docteur Bre-Sal, éminent neurologue alien, a découvert le secret des neurotransmetteurs et explique les vertus de cette trouvaille.
S01E19 - Apparences
L'équipe se retrouve dans un monde à structure féminine, axé sur la possession d'une fougère fluorescente extrêmement rare.
S01E20 - Les idoles
S01E21 - Baptême de l'air
La faculté de voler dont Harrison est si fier, soulève des doutes. En effet, il est le seul des aspirants à ne pas arriver à chevaucher d'énormes oiseaux de proie servant de montures à une communauté alien.
S01E22 - Grave erreur
Le système d'irrigation créé par Seattle pour une planète alien ne fonctionne pas...
S01E23 - Illustrations
Stacey se fait peindre un motif sur la peau par des extraterrestres. Mais la peinture contient un microbe qui se répand rapidement dans son organisme...
S01E24 - Longue route
Quand l?équipe entre en contact avec les Motai, Seattle tient à les aider à améliorer leur qualité de vie grâce à un projet d?irrigation audacieux.
S01E25 - Civilisation
L'équipe se retrouve dans un musée alien consacré à l'histoire de la Terre. Les membres assistent à une lutte entre un Napoléon et un César androïdes..