Sept ans après la mort de Michael, Sara a refait sa vie et son frère est retombé dans ses vieux travers, s'attirant les ennuis. Libéré de prison pour bonne conduite, T-Bag reçoit un étrange courrier laissant supposer que Michael Scofield pourrait être en vie. Il transmet rapidement le message à Lincoln, lequel peine évidemment à y croire. Mais depuis cette nouvelle, quelqu'un cherche à le tuer...