Un homme manque de peu son intronisation dans une loge maçonnique. Il est assassiné. En fait, c'est une femme : le jeune inspecteur William Murdoch, passionné par les sciences, et son associée d'enquête, Julia Ogden, médecin pathologiste, se lancent sur la piste. Un sexagénaire tué à coups de hache, une dompteuse dévorée par son tigre et une étrange collection de momies leur donnent aussi du fil à retordre.
A Bristol, en Angleterre, l'inspecteur Murdoch est blessé par balle alors qu'il tentait d'échapper à deux mystérieux assaillants. Il se réfugie dans une auberge et ne doit son salut qu'à la tenancière de l'établissement, qui accepte de le cacher. Mais quand la brave dame lui demande qui il est et pourquoi ces hommes en ont après lui, Murdoch répond qu'il n'en sait rien, pour la bonne raison qu'il n'a aucun souvenir remontant à plus d'une semaine : il ne sait ni comment il s'appelle, ni d'où il vient. Pour échapper à une mort certaine, Murdoch doit absolument remonter l'écheveau de sa mémoire. Pendant ce temps, à Toronto, l'inspecteur Slorach est chargé de retrouver le disparu...
S03E02 - La grande muraille
Murdoch enquête sur la mort d'un agent de police dont le corps a été retrouvé dans le quartier chinois de Toronto, qui se trouve hors de sa juridiction. Amené à côtoyer les policiers du poste cinq le temps de boucler l'affaire, Murdoch découvre que ses collègues ne s'embarrassent pas de scrupules. Non seulement le mort touchait des pots de vin, mais il n'était pas le seul dans son cas. Après avoir soupçonné un vieil herboriste chinois, Feng Choy, Murdoch oriente ses recherches sur les équipiers de l'agent. Il ne manque pas de se mettre à dos toute la brigade, qui continue à accuser l'herboriste. Or la fille de ce dernier a disparu...
S03E03 - Victor, Victoria
Au cours d'une cérémonie initiatique, Victor Bernard, qui vient de prêter serment, meurt empoisonné après avoir bu du vin dans un crâne. Murdoch est aussitôt appelé sur place. Quel n'est pas son étonnement quand il découvre que l'inspecteur Brackenreid et l'agent Crabtree sont des membres éminents de cette confrérie de francs-maçons ! La plus grande surprise est à venir. En effet, l'autopsie révéle que Victor était en réalité une femme...
S03E04 - Enfant riche, enfant pauvre
Alors qu'il jouait dans le parc avec son ami Robert, Bobby Brackenreid, le fils de l'inspecteur Brackenreid, âgé de 7 ans, est kidnappé. L'opération semble avoir été préparée avec soin. Distraite, la maman n'a rien vu. Lorsque le père de Robert, Henry Stanton, un riche brasseur, reçoit une demande de rançon, Murdoch et ses collègues comprennent que le ravisseur s'est trompé de cible. Brackenreid s'inquiète. Que fera le criminel lorsqu'il découvrira qu'il ne détient pas le bon petit garçon ? Tandis que toute la brigade s'active, le policier réfléchit à sa relation avec son fils et se demande s'il n'a pas trop négligé son rôle de père...
S03E05 - Suspects multiples
Alexander Taylor a été retrouvé mort dans son salon, le jour de son anniversaire. L'homme a été massacré à la hache. Lorsqu'on découvre Charlotte, la fille de la victime, prostrée dans sa chambre, l'arme du crime en main, la police croit l'affaire déjà résolue. Charlotte admet avoir probablement tué son père, même si elle n'a aucun souvenir de l'événement. La déposition de la jeune femme intrigue Murdoch et ses collègues. En effet, elle prétend souffrir de telles amnésies chaque fois qu'elle est possédée par le diable. Croyant avoir affaire à un cas de dédoublement de la personnalité, Murdoch décide de consulter un spécialiste, le docteur Roberts...
S03E06 - Ascenseur pour un tableau
Murdoch et ses collègues assistent dans un grand immeuble à une importante réception, au cours de laquelle une inestimable oeuvre de Rembrandt doit être dévoilée. La toile doit descendre onze étages sous la supervision de la police. Crabtree et Higgins sont chargés de la réceptionner au rez-de-chaussée. Mais la porte de l'ascenseur s'ouvre sur le cadavre d'un agent de sécurité. Le tableau a été volé. Avant même de découvrir l'auteur de ce forfait, Murdoch et ses collègues doivent tenter de comprendre comment il s'y est pris. C'est alors que les deux voleurs présumés, des professionnels venus de Chicago, sont retrouvés morts à leur tour. Leur mystérieux commanditaire s'est donc débarrassé d'eux...
S03E07 - Cirque sanglant
Kitty Walker, employée d'un cirque où elle s'occupait des tigres, est retrouvée morte, apparemment tuée par l'un des félins dont elle avait la charge. La célérité avec laquelle les forains tentent de quitter la ville met la puce à l'oreille de Murdoch, qui fait embarquer tout le monde. Le directeur, Pierre Barnett, jure qu'il s'agit d'un accident. Mais l'autopsie pratiquée par Julia révèle que l'animal fautif avait été sciemment affamé plusieurs jours avant l'attaque. De même, ce n'est pas un coup de griffe, mais un coup de couteau. Alors que les soupçons se portent sur le magicien de la troupe, un second meurtre vient compliquer l'affaire...
S03E08 - Futur imparfait
Murdoch est invité à se rendre à une réception donnée par un certain James Pendrick et destinée à promouvoir les idées de la Société d'eugénisme. Il se rend sur place avec Julia, mais la soirée ne lui plaît guère, malgré la présence du célèbre écrivain HG Wells. Il soupçonne même Pendrick d'avoir lui-même organisé le vol de sa collection d'art afin d'empocher la police d'assurance. Murdoch se sent un peu plus dans son élément lorsqu'on retrouve des membres humains dans une mare des environs. La victime est identifiée : il s'agit d'un membre éminent de la Société d'eugénisme. Le limier se met aussitôt en chasse. Pendant ce temps, Crabtree enquête sur la disparition suspecte de plusieurs chiens...
S03E09 - Le passé déterré
Deux cadavres sont découverts sur un site de construction. Julia, qui pratique l'autopsie, remarque leur parfait état de conservation, ce qui lui permet d'estimer leur mort à plus de 22 ans. L'homme et la femme ont tous deux été empoisonnés au cyanide. La suite de l'enquête révèle que le meurtre est encore plus ancien que les premières estimations. Le couple avait une fille, Rebecca Hastings, aujourd'hui très âgée, mais toujours en vie. Murdoch décide de l'interroger. Aurait-elle assassiné ses parents avec l'aide de son mari Charlie ? Pour quel sombre motif familial ? Alors que l'enquête se poursuit, Penny Ranton, la cousine de Crabtree, originaire de Belleville, Ontario, arrive en ville...
S03E10 - Manoir hanté
Murdoch se rend au manoir Beaton pour enquêter sur la mort du propriétaire des lieux, Chauncey. L'homme est tombé du balcon. Accident ? Suicide ? Meurtre ? Le policier ne peut rien tirer des domestiques. Ils attribuent la mort de leur maître à la maison elle-même, qui serait hantée. Un suspect : Ronald, le frère de la victime, qui se trouvait dans la maison. Son autre frère, Byron, devait les rejoindre. Peu avant de mourir, la victime aurait crié le nom d'un troisième frère, Timothy. Or celui-ci est mort depuis plusieurs mois. Son fantôme serait-il à l'oeuvre ? C'est la thèse des domestiques. Celle de Murdoch est plus prosaïque : quelqu'un veut hériter du manoir. Mais quand la police voit à son tour le fantôme, ses certitudes vacillent...
S03E11 - Le bourreau
Cecil Fox, un condamné à mort, parvient à survivre à sa pendaison. Peu avant l'exécution de la sentence, le prisonnier avait ingéré un tube transparent lui permettant de respirer, tandis que la corde avait été trafiquée de telle manière que sa nuque ne se brise pas dans l'impact. Le bourreau, Theodore Pleasant, est immédiatement soupçonné de complicité. Or il s'agit de l'un des bons amis de Brackenreid. Le policier est pourtant le premier à reconnaître que les preuves sont accablantes. L'affaire se complique quand Murdoch découvre, à sa grande stupéfaction, que Fox a peut-être été victime d'une erreur judiciaire...
S03E12 - La vérité nue
Lors d'une promenade dans un parc, Murdoch et Julia découvrent le cadavre d'une jeune femme. L'enquête permet de mettre au jour une série de photographies osées de la victime. L'auteur des clichés, Marcus Evans, un artiste pornographique bien connu de la police, dénie toute responsabilité dans la mort de la malheureuse. Murdoch est surpris de découvrir que Sally Pendrick, la femme d'un criminel, a également posé pour Marcus. Il se rend aussitôt chez la dame, qui lui avoue qu'un inconnu tente de la faire chanter. Alors que Murdoch poursuit son enquête, Julia se persuade que sa relation avec le policier ne mène nulle part. Elle envisage de quitter Toronto...
S03E13 - L'effet Tesla
Murdoch mène l'enquête sur la mort par électrocution de Morris Garbutt, un scientifique. Morris fut un temps l'associé de Nikola Tesla, qui affirme avoir expérimenté avec succès une nouvelle forme d'énergie se transmettant par l'air. Le savant semble pourtant hors de cause. Dans cette affaire, toutes les preuves convergent vers un certain James Pendric, mais celui-ci est en prison. Murdoch se rend compte qu'il a été berné. Comme un malheur ne vient jamais seul, Julia lui fait part de son projet d'accepter le poste de chef du service de chirurgie pédiatrique de Buffalo. Le policier est accablé...