S12E01 - Histoire secrète : l’équipe la plus forte !
En se dirigeant vers le champ de bataille, Naruto se retrouve nez à nez avec A et Tsunade, qui refusent de le laisser passer.
S12E02 - Les deux soleils
Killer Bee s'oppose à son frère et tente de créer une ouverture pour Naruto, mais tous deux sont envoyés à terre par A. Tsunade décide de s'interposer.
S12E03 - Fendeuse de Heaumes ! Akebino Jinin
Après avoir reçu le parchemin et le pinceau géants pour exécuter le sceau de l'ANBU Racine, Kakashi les apporte à Saï et demande à Rock Lee de le protéger.
S12E04 - L’utilisatrice de Shakuton ! Pakura du village caché du sable
Maki se souvient de sa jeunesse, lorsqu'elle était apprentie de l'héroïne du village de Suna, Pakura, s'entraînant pour venger la mort de son père.
S12E05 - Ce que l’on ne peut retrouver
Face aux questions de A, Tsunade se remémore sa première rencontre avec le jeune ninja et le pari qu'elle avait fait avec lui.
S12E06 - Celui sur qui il faut parier
En découvrant comment les hommes du Raikage ont été attaqués par des mercenaires, Tsunade en conclut que A est infecté par une larve d'insecte explosif.
S12E07 - Menace, tandem Jinpachi / Kushimaru
Alors que Kakashi annonce, sur le champ de bataille, la victoire de Saï sur l'un des ninjas épéistes pour remonter le moral des troupes, un nouveau combat se prépare.
S12E08 - Les épées de tonnerre ! Ameyuri Ringo
Attaqué par l'épéiste Ameyuri Ringo utilisant la technique des Crocs de la foudre, le groupe d'Omoï a désespérément besoin de renfort.
S12E09 - Puissance - Première partie
Alors que le cimetière de Konoha a été profané et la faux de Hidan volée dans la forêt des Nara, Tsunade envoie Yamato, Saï, Naruto et Sakura au village de Tonika.
S12E10 - Puissance - Deuxième partie
Après s'être libéré de l'étreinte des serpents de Kabuto, Naruto se rend à Hachô, accompagné de Sakura et Shiseru, l'une des gardes de la milice du village.
S12E11 - Puissance - Troisième partie
Mina est effrayée par ses visions de Naruto et de serpents. Kabuto décide de créer une nouvelle invocation. Naruto accepte d'entraîner les enfants du village.
S12E12 - Puissance - Quatrième partie
Alors qu'il se débarrasse du parchemin de contrôle de Kabuto et s'apprête à attaquer Dokku, Shiseru et les enfants, le clone Naruto-Kyûbi est contré par Gaï et Rock Lee.
S12E13 - Puissance - Cinquième partie
Le chef du village de Hâcho se révèle être le véritable cerveau derrière l'attaque de Tonika, et Naruto tente de se défaire des serpents.
S12E14 - Puissance - Épisode final
Disonasu est tué par un démon. Alors qu'il engage le combat contre ce dernier, Naruto est sérieusement blessé. Kyûbi décide de lui prêter son chakra.
S12E15 - Naruto part au front !
Mabui et Shikaku font un résumé de la situation sur les différents champs de bataille.
S12E16 - Les sentiments de mon père, l’amour de ma mère
Le Quatrième Kazekage se souvient de la mort de Karura et de la naissance de Gaara, ainsi que du test qu'il lui a fait passer enfant.
S12E17 - Rencontre tant attendue, Naruto contre Itachi
Naruto et Killer Bee se retrouvent face à Itachi et Nagato. Les deux anciens membres de l'Akatsuki sont impressionnés par les pouvoirs de Naruto sur le chakra de Kyûbi.
S12E18 - Estime
Naruto tente de se libérer en vain de l'étreinte de Nagato. Alors qu'il vient à son secours, Killer Bee se retrouve coincé et la situation devient critique.
S12E19 - Mizukage, palourde et mirages
Sur le champ de bataille où l'unité de Gaara combat les anciens Kage, le Troisième Raikage et le Deuxième Mizukage se libèrent de l'emprise du sable.
S12E20 - Contradiction
L'unité Fûton de Temari ne parvient pas à faire le moindre mal au Troisième Raikage qui, selon Dodaï, posséderait l'armure et l'attaque ultimes.
S12E21 - Peur - Tyran de vapeur
Remplaçant Oonoki pour le protéger de l'attaque du Deuxième Mizukage, Gaara enferme ce dernier dans une gigantesque pyramide de sable que les ninjas tentent de sceller.
S12E22 - Fantômes du passé
Les clones blancs de Zetsu sèment le doute chez les ninjas de l'alliance. Shikamaru révèle qu'une stratégie a été mise au point pour démasquer les imposteurs.
S12E23 - Téléportation infernale
Après l'activation de leur technique, Jirôbô, Kidômaru, Sakon, Ukon et Tayuya disparaissent, laissant leurs adversaires dans un état de biostase.
S12E24 - Vengeurs
Les ninjas de Konoha continuent leur combat au sein de la dimension spéciale. Shikamaru révèle la stratégie du quartier général pour se débarrasser des Zetsu blancs.
S12E25 - Les yeux du cœur
En couvrant les arrières de Neji lors d'un combat face aux Zetsu blancs, Hinata se remémore son entraînement pour le rite de passage du clan Hyûga.