A la suite des derniers événements et de la révélation faite à Odo par le Korrigan au moment de sa mort, une grande fébrilité règne sur Deep Space Nine. L'équipage tente de se préparer le mieux possible à une éventuelle invasion du Dominion. C'est alors qu'une flotte de vaisseaux Klingon fait son apparition et demande l'autorisation d'accoster sur la station. La rumeur d'un coup d'Etat sur Cardassia circule et les Cardassiens ont d'ailleurs fermé leurs frontières...
S04E02 - La tradition du guerrier
Sisko essaye de convaincre les Klingons de cesser les attaques contre Cardassia. Il tente désespéremment de leur expliquer qu'il s'agit en fait d'une tactique du Dominion afin d'affaiblir les forces en présence dans le Quadrant Alpha en les retournant les unes contre les autres.
S04E03 - Le visiteur
Quelques décennies dans le futur, Jake Sisko, devenu un vieil homme, vit dans la demeure de son grand-père en Louisiane. Par une nuit pluvieuse, une jeune femme lui rend visite. Elle est écrivain et s'appelle Mélanie. Il lui raconte l'histoire qui a hanté son existence et qui l'a poussé, lui, Jake Sisko le grand écrivain, à arrêter d'écrire à quarante ans. Quand il avait 18 ans, son père a disparu au cours d'une mission à bord du Défiant. Dématérialisé, il fut tout d'abord donné pour mort mais ce n'était pas le cas puisqu'il réapparut ensuite périodiquement, mais trop peu de temps à chaque fois pour que l'on puisse lui porter secours. Pourtant, Jake finira par trouver une solution pour sauver son père, mais à quel prix
S04E04 - Le serment d'Hippocrate
Après une mission dans le Quadrant Gamma et alors qu'ils sont sur le chemin du retour, Bashir et O'Brien captent ce qui leur semble être le message d'un vaisseau en détresse, provenant d'une planète inhabitée. Alors qu'ils s'y rendent afin de porter secours aux occupants du vaisseau, ils rencontrent un accueil plus qu'hostile. Les Jem'Hadar les font prisonniers et s'apprêtent à les tuer quand leur chef, Goran'Agar, apprend que Bashir est médecin. Il ne le laissera vivre que s'il réussit à trouver le moyen de libérer ses compagnons de leur dépendance génétique, nécessaire à leur survie...
S04E05 - Indiscrétion
Un contrebandier bajoran révèle à Kira qu'il a retrouvé un morceau de métal semblant provenir du Ravinok, un vaisseau cardassien disparu six ans plus tôt avec tout un groupe de prisonniers bajorans à son bord. Un des amis de Kira se trouvait sur le Ravinok et elle décide immédiatement de mener une enquête à ce sujet. Elle apprend bientôt qu'un représentant cardassien souhaite l'accompagner dans ses investigations. Ayant accepté à contrecoeur, elle découvre que le représentant en question n'est autre que Dukat. Le contrebandier leur montre le fragment trouvé dans le système de Dozoria et ils l'identifient comme provenant bien du Ravinok. Kira et Dukat retrouvent finalement l'épave de l'appareil. Découvrant douze tombes non loin de l'engin, ils réalisent qu'il y a peut-être eu des survivants à cette catastrophe...
S04E06 - L'interdit
Sisko convoque Dax dans son bureau pour lui annoncer une importante nouvelle. En effet, un groupe de scientifiques Trill, dirigé par le Dr. Lenara Khan, va utiliser le Défiant pour une série d'expériences. Lenara est un Trill qui, quand son symbiose occupait un autre corps, était marié à un ancien hôte masculin de Dax. Une règle très stricte chez les Trills interdit formellement toute relation entre amants de "vies antérieurs". Le bannissement, voire la mort du symbiose au moment du décès de son hôte, sont les risques encourus par ceux qui enfreindraient cette règle. Persuadée de pouvoir contrôler ses sentiments pour son ancienne épouse, Dax décide d'assister au dîner de réception donné en l'honneur des scientifiques. Les deux femmes se rencontrent et, malgré le ton anodin de leur conversation, l'attirance renaît immédiatement entre elles...
S04E07 - Les Karemmas
Le capitaine Sisko et ses officiers embarquent à bord du Défiant en direction d'un lointain système du Quadrant Gamma. Ils doivent en effet y rencontrer Hanok, le représentant des Karemmas, et mener avec lui des négociations d'ordre commercial. Au cours de la discussion, deux engins de guerre jem'hadar sont repérés. Très vite, ils prennent le vaisseau des Karemmas pour cible et celui-ci tente de se protéger en fuyant dans l'atmosphère gazeuse et très dangereuse d'une planète proche. Sisko décide de les suivre dans cette périlleuse entreprise. Le Défiant est bientôt pris dans de violentes turbulences
S04E08 - Les petits hommes verts
Quark est très excité à l'idée de recevoir enfin la navette que son cousin Gaila lui devait depuis dix ans. Il décide de l'utiliser au plus vite et propose à Nog de le conduire sur Terre, où il doit rejoindre la Starfleet Academy. Bien entendu, Quark espère aussi en profiter pour mener à bien un des petits trafics dont il a le secret. Ainsi, accompagnés de Rom qui pilote l'engin, ils prennent la direction de la Terre. Ils sont presque à destination quand la navette donne des signes de dysfonctionnement grave, à tel point que le crash ne peut être évité. Nos trois amis s'en sortent indemnes, mais ils ont la désagréable surprise de se réveiller dans une salle destinée aux examens médicaux. Des militaires américains tentent de communiquer avec les trois Ferengui : nous sommes à Roswell, Nouveau-Mexique, en 1947
S04E09 - L'épée de Kahless
Worf s'apprête à accompagner Dax et Kor, un guerrier klingon entré dans la légende, pour une mission visant à retrouver l'épée de Kahless, une arme vieille de plus de mille ans et fortement chargée de sens puisqu'elle fut celle du premier chef de l'empire klingon. Après un entretien bien arrosé avec Worf, Kor est attaqué alors qu'il regagne ses quartiers. Son agresseur lit dans ses pensées, avant de faire disparaître tout souvenir de l'incident. Sisko, qui espère rétablir les relations entre la Fédération et les Klingons, fait son possible pour favoriser leur voyage vers le Quadrant Gamma
S04E10 - Notre homme Bashir
Bashir a loué une holosuite, censée le transformer pour un temps en un séduisant agent secret, exerçant sa avec l'accord du docteur. Cependant, à la suite d'un accident, les formes physiques de Sisko, Kira, Dax Worf et O'Brien se retrouvent intégrées au programme. Contacté par Bashir, Eddington, qui tentait de retrouver les officiers disparus, lui conseille de faire durer le programme autant que possible, car la fin du jeu pourrait bien signifier la mort de ses compagnons. Bashir va devoir jouer les James Bond pour sauver ses compagnons! Kira, qui n'a aucune conscience de sa personnalité réelle, incarne Anastasia, une espionne russe qui l'entraîne à la recherche d'un scientifique disparu, dont la photo ressemble étrangement à Dax
S04E11 - L'enfer sur terre
Une explosion à la conférence diplomatique entre la Fédération et les Romuliens tue 27 personnes. Il est vite établi que la bombe a été posée par un Korrigan, ce qui signifie que le Dominion s'attaque à la Terre. Sisko et Odo sont convoqués à San Francisco pour rencontrer l'amiral Leyton. Une fois sur place, l'amiral les informe que Sisko est nommé responsable de la sécurité de Starfleet sur Terre. Cette nomination prenant effet immédiatement. Un voyage sur Terre signifie également pour Sisko et son fils, Jake, une petite visite à la maison. Ils se rendent donc dans le restaurant tenu par le père de Sisko, Joseph. Plus tard, notre nouveau responsable de la sécurité rencontre le président de la Fédération, Jaresh-Inyo
S04E12 - Paradis perdu
Le sabotage attribué au Dominion a provoqué une vive émotion sur Terre. L'état d'urgence est déclaré et les troupes armées de Starfleet sont partout. Malgré tout, les activités d'un groupe d'élite de l'école d'officiers de Starfleet au cours de la fameuse nuit éveillent les doutes de Sisko. Faisant semblant d'être au courant de l'affaire, il amène l'un des membres du groupe en question à lui révéler que c'est bien Starfleet qui a provoqué l'incident, par le biais de ses élèves officiers. Sisko craint que l'amiral Leyton ne souhaite renverser le gouvernement de la Fédération pour le remplacer par un régime militaire
S04E13 - Feux croisés
Le Premier ministre Shakaar arrive sur Deep Space Nine pour négocier l'admission de Bajor dans la Fédération. Sa présence crée une certaine agitation sur la station, surtout chez Kira, restée une proche amie depuis qu'elle a combattu sous ses ordres dans la Résistance. De plus, depuis l'arrivée du dignitaire bajoran, Odo a appris qu'un groupe d'extrémistes cardassiens se préparait à tenter de l'assassiner
S04E14 - Touché par la grâce
A la demande du Premier ministre Shakaar, Kira se prépare à se rendre dans un avant-poste cardassien, où sont réunis des diplomates bajorans et cardassiens, dans le but d'unir leurs forces en mettant en commun leurs connaissances de l'empire klingon. A sa grande surprise, le commandant du transporteur qui doit l'y conduire est une de ses vielles connaissances : Dukat. Ce dernier va lui raconter comment il a perdu son rang. Dukat a eu une fille de sa maîtresse bajorane. Cette fille, Tora Ziyal, il l'a ramenée sur Cardassia, ce qui a brisé sa vie et sa carrière. Ziyal et son père sont maintenant bannis et le vaisseau est leur seule demeure. Au moment où ils atteignent le lieu de la conférence, Kira et Dukat découvrent que l'avant-poste a été attaqué par les Klingons et que les diplomates cardassiens et bajorans sont morts
S04E15 - Les fils de Mogh
Kurn, le frère de Worf, arrive sur la station et demande à son frère de le tuer. Il lui explique que, depuis que Worf s'est rangé aux côtés de la Fédération dans le combat qui l'oppose à l'empire Klingon, Kurn et sa famille sont considérés comme des parias par les leurs. Ayant tout perdu, il ne peut regagner son honneur que par une mort rituelle, que seul Worf peut lui infliger. Malgré ses réticences, Worf accepte finalement d'accomplir le rituel et donne à son frère le coup de poignard qui doit réaliser son souhait. Dax et Odo font irruption à temps pour transporter Kurn à l'infirmerie
S04E16 - Le syndicat
Rom souffre depuis des semaines d'une infection à l'oreille sans que son employeur, néanmoins frère, ne lui ait accordé un seul jour de congé. Il finit par faire un malaise dans le bar et est conduit à l'infirmerie. Là, Bashir est choqué d'apprendre comment Quark traite son personnel et suggère même à Rom de s'unir avec les autres employés pour obtenir quelques concessions de leur patron. Quand Rom retourne au bar, c'est pour entendre son frère annoncer une diminution des salaires, afin de compenser une baisse de bénéfices. Inspiré par les propos de Bashir, Rom provoque une réunion secrète des employés de Quark
S04E17 - Accession
Mystérieusement surgi du vortex, un vaisseau bajoran vieux de plusieurs siècles transporte à son bord le légendaire poète Akorem Laan. Immédiatement conduit à l'infirmerie du bord, celui-ci est très choqué d'apprendre que deux siècles se sont écoulés depuis son départ de Bajor. Il raconte à Sisko et Kira qu'il a eu un accident dans l'espace et que ce sont les Prophètes qui l'ont sauvé. Ils lui auraient laissé entendre qu'il avait été choisi pour être l'Emissaire. Sisko, qui n'avait jamais été très à l'aise avec l'idée qu'il était sans doute cet Emissaire, laisse volontiers à Akorem cette position enviée
S04E18 - Les règles du combat
Worf doit faire face au jury qui doit déterminer s'il doit être exclu de l'Empire Klingon. Il est accusé d'avoir volontairement détruit un vaisseau civil. Worf a bien donné l'ordre de tirer sur ce vaisseau, mais apparemment sans savoir qu'il s'agissait d'un transport civil. Ch'Pok, l'avocat des Klingons accuse Worf de négligence, engendrée par son tempérament naturellement belliqueux, voir sanguinaire. Quant à Sisko, le conseiller de Worf pour sa défense, il déclare qu'il s'agit seulement là d'un regrettable accident. Quand Dax est appelée à témoigner, elle est bien obligée de raconter que la veille de l'incident, Worf avait loué une Holosuite simulant une bataille
S04E19 - La mémoire emprisonnée
Accusé d'espionnage par une race étrangère, O'Brien est condamné à une bien étrange peine : on altère sa mémoire en y implantant le souvenir de ving années de prison. Ses compagnons arrivent trop tard pour emêcher le processus qui, bien qu'il n'ait duré que quelques heures, a durablement modifié la mémoire du condamné. Quand il revient sur Deep Space Nine, on a beau lui expliquer qu'il n'a rien vécu de tout cela, les souvenirs sont trop vivaces pour pouvoir être ignorés. Pendant que Bashir cherche comment effacer cette mémoire artificielle, O'Brien doit se faire aider par un conseiller pour faire face aux effets psychologiques dévastateurs de cette punition
S04E20 - Et le miroir se brisa
Quand Sisko lui présente une femme qui ressemble à s'y méprendre à sa mère décédée, Jake n'en croit pas ses yeux. Il n'est pourtant pas au bout de ses surprises car il s'agit bien de Jennifer, ou plus exactement de son double dans un univers parallèle. Sisko l'avait rencontrée lors d'une visite dans ce monde où elle était mariée avec le double maintenant décédé du capitaine. Sisko les laisse quelques instants seuls à seule mais, quand il revient, ils ont tous les deux disparu. Seul demeure dans la pièce un petit engin dont Sisko réalise qu'il sert à passer dans l'autre univers
S04E21 - La muse
Lwaxana Troi rend une visite à Odo et lui annonce la surprenante nouvelle de sa grossesse. Heureuse à l'idée d'avoir un garçon, elle se heurte pourtant à un problème majeur. En effet, son mari souhaite qu'elle se soumette à la coutume et qu'elle lui confie l'enfant pour qu'il l'élève seul jusqu'à ses seize ans. Refusant de "donner" son bébé, elle souhaite accoucher sur Deep Space Nine
S04E22 - Pour la cause
De récentes révélations semblent indiquer qu'il y aurait à bord de Deep Space Nine un membre du groupe terroriste le Maquis. Le nom de cette personne est connu, il s'agit de Kasidy Yates. Sisko est sidéré d'apprendre que sa petite amie est peut-être un agent terroriste. Quand Kasidy veut quitter la station pour une nouvelle livraison, Odo insiste pour faire une inspection sanitaire d'urgence de son vaisseau
S04E23 - Combat pour la mort
Quand la station Deep Space Nine subit l'attaque d'un groupe de Jem'Hadar, Sisko réunit Worf, Dax, Odo et O'Brien et, à bord du défiant, ils poursuivent ces agresseurs dans le Quadrant Gamma. Ils tombent bientot sur le signal de détresse d'un vaisseau de guerre Jem'Hadar sérieusement endommagé
S04E24 - La peste
Alors qu'ils voyagent dans le Qadrant Gamma, Kira, Dax et Bashir répondent à un signal de détresse émis automatiquement depuis une planète victime des Jem'Hadar deux siècles plus tôt. Leurs agresseurs ont inoculé aux habitants une maladie incurable, transmise de génération en génération. Cette affection provoque l'apparition de taches bleues, qui, la fin approchant, deviennent rouge, alors que le malade souffre énormémernt
S04E25 - Un contrat est un contrat
Quark vient d'apprendre qu'il est sans doute porteur d'une maladie extrêmement grave qui pourrait le tuer très rapidement. Comme le veulent ses traditions, il souhaite mourir en ayant payé ses dettes. Il met donc ses organes en vente par le biais d'un système d'échange ferengui, dans l'espoir de réunir la somme nécessaire. Pendant ce temps, Keiko O'Brien, qui est enceinte, Bashir et Kira reviennent à la station après avoir été victimes d'un sévère accident. Quand O'Brien rend visite à son épouse, il découvre que c'est Kira qui porte désormais leur enfant et que c'est elle qui va devoir mener à terme cette grossesse
S04E26 - Flux brisé
Odo est conduit à l'infirmerie après un inquiétant malaise. Après de nombreux examens, Bashir en arrive à penser qu'il est en train de perdre sa capacité à prendre et à conserver une forme solide. La raison de ce phénomène reste cependant mystérieuse et Bashir parvient à convaincre son patient de rester en observation et de bouger le moins possible, tout mouvement pouvant conduire à un accident du même type. Afin de distraire son esprit de ces problèmes, Kira lui apporte des rapports à lire. Un détail ayant attiré l'attention d'Odo, il quitte l'infirmerie pour mener son enquête. Il est bientôt victime d'un nouveau malaise