Une invitation dans une ville inconnue ne peut que signifier que quelque chose d'amusant est sur le point de se produire. Cid suit Claire dans la Cité de l'Anarchie où il s'est lancé dans sa nouvelle quête : traquer la vampire fondatrice connue sous le nom de la Reine Sanglante qui dort quelque part dans ce pays. Les choses sont sur le point de se gâter entre les figures les plus puissantes de la Cité et Shadow Garden, alors qu'ils se rapprochent de la découverte d'informations cruciales sur les Possédés.
Claire emmène Cid à la Cité sans loi, où les rues sont en proie aux attaques de goules. La couleur rouge de la lune semble annoncer la résurrection de la mystérieuse Reine sanglante.
S02E02 - La terre du repos
Ayant décidé de faire cause commune, Claire et Mary parviennent à pénétrer dans la Tour rouge, où elles trouvent des membres de Shadow Garden en train consulter des archives. Beta, la meneuse du groupe, leur explique en quoi la Reine sanglante est importante pour leurs recherches.
S02E03 - L'heure du réveil
Alors qu’elle cherchait Cid à l'intérieur de la Tour rouge, Claire est sauvagement attaquée par Élisabeth, qui est sortie transfigurée de la rose dans laquelle elle sommeillait. Aussitôt, une équipe de Shadow Garden accourt sur les lieux et arrache Claire des griffes de la Reine sanglante.
S02E04 - Le Masque du mensonge
Dans la capitale du royaume de Midgar, l’Union des compagnies cherche par tous les moyens à détruire la firme Mitsugoshi, qui a fondé sa propre banque. Voyant dans cette bataille l’occasion de s’enrichir, Cid élabore un plan qu’il propose à Yukime, sa nouvelle équipière.
S02E05 - Celui qui tire les ficelles
Gamma emploie des moyens explosifs pour repousser les visiteurs nocturnes que Gettan a envoyés au magasin Mitsugoshi. Dans une mine désaffectée de la zone frontalière, Yukime présente à l'agent John Smith les faux billets qu’elle a fabriqués.
S02E06 - John Smith
Conformément aux ordres d’Alpha, Delta attaque John Smith à bord du train qui transporte les pièces d’or. Découvrant que sa proie n’est autre que Shadow, elle abandonne le combat et accepte une mission secrète dans la Cité sans loi.
S02E07 - Ce qui m'est cher
À la capitale de Midgar, la diffusion de faux billets provoque la panique des consommateurs, qui se ruent dans les banques. L’Union des compagnies subit le choc de plein fouet, mais Alpha et ses camarades craignent que Mitsugoshi périsse également. En outre, elles sont persuadées que Shadow les a abandonnées.
S02E08 - Les larmes du dragon
À l’invitation de Jaga et Hyoro, les membres de Shadow Garden passent une journée au nouveau complexe thermal du groupe Mitsugoshi. Tout en goûtant à un repos bien mérité, Alpha et ses camarades se demandent pourquoi Shadow les a attirées dans cet endroit.
S02E09 - La Clé
Après son départ du royaume de Midgar, Cid est arrivé par hasard à Saisho, une petite ville qui vient de subir les ravages de la guerre. Il loge dans un hôtel tenu par Marie, qu'il avait déjà croisée à la Cité sans loi. De son côté, Rose a été choisie par l'agent 559 pour accomplir une mission secrète près de la résidence d'été de la famille royale.
S02E10 - L'oiseau en cage
Avec le concours inattendu d’Epsilon, Cid s’infiltre dans le palais royal d’Oriana sous les traits d’un apprenti pianiste. Après s’être taillé un franc succès devant un parterre d’aristocrates, il cherche Rose pour l’empêcher d’épouser Thomas Zoschist.
S02E11 - La décision
Au palais royal d’Oriana, tout est en place pour le mariage. En épousant la princesse Rose, Thomas Zoschist veut acquérir la bague qui lui permettra de devenir chevalier de la Table ronde. À l’écart des invités, la servante Margareth est aux petits soins pour Cid, ce qui a le don d’irriter Epsilon.
S02E12 - Tout en haut
Dans la capitale d'Oriana en proie au chaos, Mordred doit s’incliner face à Epsilon et Beta, mais il compte sur la puissance de Ragnarok pour retourner la situation. En attendant l’heure de la revanche, il donne à ses adversaires des explications sur la Rose noire et sur les mondes parallèles.