Saya Kisaragi est une jeune fille somme toute ordinaire vivant avec son père Tadayoshi, prêtre d'un temple shintoïste. Elle va au lycée, a des amis et est une incurable gloutonne, mais lorsque son devoir l'appelle, celle-ci part combattre des créatures appelées les Âgés (ou Anciens) avec l'épée sacrée qui se transmet dans sa famille. Cependant cet équilibre entre ses deux vies est petit à petit bouleversé lorsque son devoir rattrape son quotidien.
Adolescente au grand cœur vivant dans un sanctuaire shintoïste dans le district d’Ukishima, Saya Kisaragi concilie habilement sa vie familiale et de lycéenne, entourée de ses camarades de classe. Mais alors qu’elle rentre chez elle après l’école, son père l’informe que les Huit Trigrammes indiquent l’apparition d’un Ancien. La jeune fille reprend la lame sacrée pour accomplir son devoir.
S01E02 - Pour toi
En dépit de ses efforts, Saya a été aperçue en train de combattre un Ancien. Pendant le déjeuner, Itsuki essaie en vain de la séduire, mais la jeune fille ne peut s’empêcher de penser au mystérieux Shinichirô Tokizane. À son retour de classe, son père lui révèle un élément qui renforce le serment que s’est fait Saya.
S01E03 - Quant aux hommes…
Un enchaînement de situations involontaires contraint Saya à nettoyer la salle de chimie à la demande de sa professeure principale. Sur le chemin du retour, elle s’arrête avec ses amis au Café Guimauve et apprend que le propriétaire d’une boulangerie a mystérieusement disparu.
S01E04 - Lamentations
La disparition du boulanger a éveillé de multiples rumeurs au sein du district d’Ukishima, ce qui intensifie la détresse de Saya qui trouve refuge auprès de Fumito. Toutefois, l’adolescente doit rester sur le qui-vive à la suite de nombreuses attaques à proximité des berges du lac. Saya doit alors faire face à une horde furieuse d'Anciens.
S01E05 - Rencontre
Les maux de tête de Saya ne cessent de s’intensifier dès lors qu’elle tente de se souvenir de son passé. Toutefois, en dépit de la fatigue, la jeune fille combat avec vigueur les Anciens, mais son comportement inquiète particulièrement ses amis, dont Nene.
S01E06 - Battue par les vents
La victoire sur le mille-pattes laisse un goût d’amertume à Saya : Nene est morte sans qu’elle n’ait pu la sauver. Le lendemain, Nono décide de confronter la jeune fille, mais son comportement est inhabituel.
S01E07 - Aussi impitoyable qu'une tempête
Meurtrie par la mort de Nene et Nono, Saya sombre dans une profonde tristesse et en vient à s’interroger sur son serment. Sur le chemin du retour, elle assiste, impuissante, à la mort d’un policier. Alors qu’elle tue l’Ancien, Shinichirô sort de la pénombre.
S01E08 - En ce monde
Shinichirô l’ayant aperçu tuer un Ancien, Saya se voit contrainte de lui révéler la triste vérité. De retour chez elle, la jeune fille découvre avec effroi son père évanoui. Apeurée, l’adolescente est de nouveau questionnée quant à la finalité de sa mission. Malheureusement pour elle, quelques jours après, un terrible incident survient…
S01E09 - Contre ma volonté
Aux prises avec l’Araignée, Saya est immobilisée par de violents maux de tête et des flash-back. Parvenant à se défaire du monstre, la jeune fille rentre chez elle et se lamente sur son sort auprès du chien. C’est alors qu’elle reçoit la visite de Shinichirô.
S01E10 - Par son souffle
Alors que Saya tente de surmonter un violent mal de tête, un Ancien l’attaque et tue, sous ses yeux, Shinichirō lorsqu’il revient pour prendre de ses nouvelles. Se lamentant de n’avoir pu sauver celui qu’elle aimait, Saya s’évanouit aussitôt.
S01E11 - Qui donc ?
Nene et Nono apparaissent toutes deux saines et sauves devant Saya, ébahie. Alors que la jeune fille tente de comprendre la situation, un violent mal de tête l’assaille. La vérité est sur le point d’éclater.
S01E12 - Je ne t'oublierai jamais
Libérée de son emprise, Saya comprend qu’elle n'est autre que les créatures qu'elle abhorre, capturée et soumise à un lavage de cerveau par Fumito, qui souhaite la libérer de son serment de ne pas se nourrir d’humains. Alors qu’une multitude de créatures se déchaînent, la jeune fille est contrainte de mener son dernier combat.