Un descendant du roi Pistachion, échappé du flux temporel en 1965 a entrepris de dominer le monde. Arrivé à notre époque, il est proche d'y parvenir. Cavendish et Dakota aidés par Doofenshmirtz remontent le temps pour empêcher la catastrophe. Milo et ses amis font la connaissance de Phineas de Ferb et de leurs proches, ils vont de leur côté se battre contre les pistachions qui sont en train d'envahir le monde et de transformer les humains en végétaux esclaves...
S02E02 - La loi de Murphy hivernale / Un rendez-vous sous contrôle
"La loi de Murphy hivernale". C'est l'hiver. Milo et Zack sont en route pour l'école. En chemin, la loi de Murphy va faire s'abattre sur eux toutes sortes de problèmes pendant qu'au collège les paris sur leur arrivée vont bon train."Un rendez-vous sous contrôle". Milo et ses amis organisent un rendez-vous entre Scott, le Sousterrien et madame Murawski, la professeure de sciences...
S02E03 - La photo / Drôles d'agents
"La photo". C'est le jour de la photo à l'école. Melissa et Zack vont tout faire pour que Milo qui n'a jamais réussi à se faire photographier puisse avoir son portrait."Drôles d'agents". Dakota et Cavendish se croient devenus des enquêteurs paranormaux. Doofenshmirtz se remémore une anecdote où il avait pris Le Chien pour un agent de l'O.S.A.S., tout comme Monogramm et Carl qui l'avaient confondu avec l'agent A, un berger allemand.
S02E04 - Un jeu sans fin / Une course endiablée
"Un jeu sans fin". Milo, Melissa et Zack vont essayer de jouer à un jeu de plateau jusqu'à son terme, chose qu'ils n'ont jamais pu faire, loi de Murphy oblige. "Une course endiablée". Les parents de Milo ont organisé une course automobile au profit des lamas dans le besoin mais la course sort du circuit et se propage dans toute la ville en causant de nombreux dégats.
S02E05 - Le concours de pâtisserie / Lady Krillers
"Le concours de pâtisserie". Milo et Amanda participent au grand jeu télévisé, "Le Gâteau Vision", présenté par l'animateur vedette, Basil. Ils affrontent d'autres équipes de collégiens dans un grand concours de pâtisserie mais la loi de Murphy va encore sévir.
S02E06 - Doof est de sortie / Disco et patin à roulettes
«Doof est de sortie». Sara ne supporte plus la présence de Doofenshmirtz qui ne sort jamais de la maison. La famille décide de le faire sortir. «Disco et Patin à Roulettes». La patinoire où les parents Murphy disputaient des concoours de disco sur patins à roulettes va fermer et organise un dernier concours auquel les Murphy, qui n'ont jamais gagné, vont tenter une dernière fois de l'emporter...
S02E07 - La vieille Bessie / C'est que le début
«La vieille Bessie». Milo, Melissa et Zack tentent de sauver la vieille horloge de la ville concue par l'arrière grand-mère de Melissa. «C'est que le début». Amanda aide Milo, Zack et Melissa à se préparer pour leur concert de l'après-midi...
S02E08 - Les trois travaux de Zack / Nous, les filles
S02E09 - L'ombre de Milo / Analyse extraterrestre
«L'ombre de Milo». Doof veut apprendre à être quelqu'un de bien et décide de suivre Milo pendant une journée, mais le résultat est catastrophique. «Analyse extraterrestre». Les extraterrestres tentent de prélever un échantillon biologique provenant de Milo mais Le Chien s'interpose...
S02E10 - Chiens et antigravité / Un vrai Murphy
S02E11 - Chute libre / Le monde de Milo
S02E12 - L'enlèvement de Milo
S02E13 - Le robot-marmite / Le chien qui en savait trop
S02E14 - Copains d'aventure / L'Inspecteur Canin
S02E15 - Le vaisseau fantôme / Une fête à tout casser !
S02E16 - La sécurité d'abord / Cavendish se déchaîne
S02E17 - Premières rencontres / Débats, arguments et destruction
S02E18 - Art et chaos / Le picnic
S02E19 - Bloqués dans l'ascenseur / Milo dans l'espace