Sous la pression de Reggie et Jake, Becker décide d'arrêter de fumer. Dans le même temps, Amanda, l'ancienne colocataire de Reggie, vient lui rendre visite. Reggie se remet alors en question
S02E03 - Tel est pris qui croyait prendre
Linda s'engage dans une association et parraine Maureen, une jeune adolescente en pleine crise de rébellion. Becker s'immisce dans la vie privée de Reggie et de son nouvel ami, Doug Schmidt, un de ses patients.
S02E04 - Les Malheurs de Linda
S02E05 - Les Copains sont de retour
S02E06 - Cap sur Buffalo
S02E07 - Révélation fatale
S02E08 - La Balle perdue
Jake est agressé dans le Bronx, et appelle Becker à la rescousse. Ce dernier est touché par une balle perdue... Emmené à l'hôpital, Becker se retrouve en tête-à-tête avec une doctoresse très ambitieuse, en l'occurence Liz Carson
S02E09 - Un Mauvais voisinnage
S02E10 - Pour un cachet d'aspirine
S02E11 - Perdu de vue
S02E12 - Le Réveillon de Noël
Becker, qui n'aime guère la période de Noël, décline l'invitation de Reggie pour la fête annuelle. Cependant, il commence à apprécier la vie après avoir passé une soirée à identifier l'un de ses patients à la morgue... Linda et Margaret célèbrent Noël ensemble et s'échangent des cadeaux en secret.
S02E13 - La Livraison
Journée plutôt agitée ! Linda a semé la pagaille dans une livraison, et le livreur est retrouvé enfermé dans la salle de bain ! Becker baptise la journée «incompétence nationale»... Reggie étudie en vue de ses examens avec un jeune étudiant, et Becker pense que celui-ci ne pense qu'à coucher avec elle.
S02E14 - La Rumeur
Une rumeur circule sur le compte de John, selon laquelle les jours du praticien seraient comptés !... Tout ça parce que Becker entreprend soudain de manger sainement et de contrôler ses ardeurs !
S02E15 - Thérapie de groupe
Après qu'il ait insulté deux agents de police, John est condamné par un juge à assister à des cours pour apprendre à gérer sa colère. Le professeur est d'un calme olympien, ce qui a pour effet d'agacer le médecin au plus haut point !
S02E16 - Vieux bougon
Arrêté par un agent de police parce que sa voiture est jugée non-conforme pour des broutilles, John décide, au lieu de faire procéder aux réparations nécessaires, de s'acheter une moto ! Ce qui fait dire à ses proches que le praticien est en pleine crise de la quarantaine !
S02E17 - Une Soirée mémorable
Liz convainc John d'organiser un dîner chez lui et la soirée s'avère être un vrai fiasco.
S02E18 - L'Appel mystère
John a une mauvaise surprise en recevant sa facture de téléphone : un appel en Californie lui est facturé, alors qu'il est persuadé de n'avoir jamais appelé si loin. Il téléphone à la compagnie pour protester.
S02E19 - Le Porteur de mauvaises nouvelles
Après qu'il a accepté de partir en vacances avec ses patients, et que l'un d'eux a rendu l'âme dans l'intervalle, John laisse un message sur un répondeur, message très maladroit qu'il va tenter de récupérer à tout prix.