1958 : le petit village de Grantchester va connaître bien des remous. Le révérend Will Davenport voit ses propres idéaux mis à mal quand son vicaire, Leonard Finch, se retrouve au cœur d’un scandale. En répercussion de cette affaire sensible, l’inspecteur Geordie Keating voit ses principes chahutés, Mme Chapman est désemparée, contrairement à Cathy Keating qui s’investit pleinement dans la défense de Leonard. L’amitié entre Will et Geordie est également mise à rude épreuve avec l'arrivée de Johnny, ancien camarade d’armée de Geordie, aujourd’hui avocat.
Alors que Will, Leonard, les Chapman, la famille Keating et Daniel Marlowe profitent de quelques jours de vacances dans le parc Merries, le propriétaire des lieux est retrouvé mort.
S06E02 - Le jugement de Salomon
Will s’apprête à baptiser le petit James Asper quand un homme fait irruption dans l’église, affirmant que c’est son fils et qu’une certaine Joan Beaumont lui a volé… Par ailleurs, Will rencontre sa nouvelle demi-sœur par alliance…
S06E03 - Bataille électorale
Le suicide du président du conseil paroissial de Grantchester déclenche des élections partielles bien plus mouvementées que d’habitude. Mais, bientôt, Reeny McArthur, la femme du défunt, reçoit une lettre qui la fait douter du suicide de son mari. Elle s’en ouvre à Will, trop heureux de se changer les idées après la mise en accusation de Leonard pour outrage à la pudeur.
S06E04 - Frères d'armes
Geordie et Will enquêtent sur la mort d’un jeune soldat américain survenue au poste de police. Le révérend doit également s’occuper de sa nouvelle demi-sœur envahissante, tout en s’inquiétant pour Leonard qui déprime à l’approche de son procès.
S06E05 - La loi et la justice
Alors que le procès de Leonard approche à grands pas et que ses amis se préparent à le soutenir, un fourgon de banque est braqué. Une bibliothécaire, témoin de la scène, alerte la police.
S06E06 - Ambitions et convictions
Une jeune étudiante, qui lutte pour le désarmement nucléaire, fait une chute mortelle lors d’une action de protestation. Au presbytère, Will se voit imposer un nouveau vicaire par l’évêque.
S06E07 - Crimes et châtiments
En prison, Leonard est témoin de la maltraitance et des violences entre détenus, jusqu’au jour où l’un d’eux, Elroy Hastings, est retrouvé mort. Le compagnon de cellule de Leonard est accusé.
S06E08 - Querelle d'amoureux
Geordie et Will enquêtent sur la mort d’un homme soupçonné de violences contre son épouse. Geordie doit faire face à sa culpabilité lorsque son passé avec Johnny Richards refait surface. De son côté, Will doit tout faire pour défendre son poste auprès de l’évêque.