Alors qu'un fléau s'abat sur Salem, Mary est intriguée par le Dr Samuel Wainwright et essaie de passer du temps avec son fils tout en luttant contre une menace de Mercy.
S02E02 - Baiser de sang
Pendant que Mary commence les préparatifs du deuxième Grand Rite et s'en prend à Mercy, Anne rencontre la puissante Comtesse Marburg et Alden retourne à Salem.
S02E03 - De l'intérieur
Mary s'allie à un ancien ennemi pour garder le contrôle de Salem pendant des élections. Elle continue à se rapprocher du dangereux Dr Wainwright.
S02E04 - Le livre des ombres
Mary ignore les mises en garde de Tituba et donne des cours à Anne Hale, Mercy prépare sa vengeance contre Mary et Cotton rencontre le Dr Wainwright à son retour à Salem.
S02E05 - La mer profonde
Mary affronte enfin son ennemie jurée, la Comtesse Marburg, pendant que Hathorne menace Anne et essaie d'arracher le contrôle de Salem à Mary.
S02E06 - Traître clair de lune
La Comtesse Marburg arrive à Salem avec son fils, Sebastian. Alden est envahi par les émotions, Anne profite de ses pouvoirs et Cotton fait une confession.
S02E07 - Sous influence
Alors que Mary et la Comtesse Marburg continuent à lutter pour le pouvoir, Cotton fait une proposition et le Dr Wainwright se rapproche de la vérité sur le fléau.
S02E08 - Les oiseaux morts
Les habitants de Salem veulent être informés, Anne en apprend plus sur son père, Tituba essaie de convaincre Alden et Mary découvre l'histoire de la Comtesse Marburg.
S02E09 - Le salaire du péché
Mary fait un sacrifice pour protéger son fils de la Comtesse Marburg, les plans de Tituba tournent mal, Anne continue ses études obscures et une querelle brutale éclate.
S02E10 - Jusqu'à ce que la mort nous sépare
La Comtesse Marburg attend la comète qui concrétisera son triomphe, mais Mary met des obstacles sur sa route. Anne prend une décision fatidique et Cotton risque la mort.
S02E11 - Sur la Terre comme en enfer
Alors que Sebastian ne sait plus à qui se fier, Mary est dénoncée en public, et Cotton et Alden unissent leurs forces pour ébranler la Comtesse Marburg.
S02E12 - Que jamais minuit ne sonne
La vie d'Alden est menacée alors que le Messager des étoiles approche. Anne apprend une nouvelle choquante et Isaac se retrouve dans une situation délicate.
S02E13 - L'heure des sorcières
Alors que la Comtesse semble triompher, Mary prépare un dernier acte de défiance, Anne savoure son propre pouvoir et Mercy est menacée par un avenir incertain.