Les ninjas ont perdu leur logement et leurs armes. Ils doivent maintenant se consacrer à entraîner Lloyd pour le jour où il affrontera son père.
S02E02 - Pirates contre ninjas
Tandis que les ninjas cherchent un dojo pour entraîner Lloyd, Lord Garmadon brandit l'arme suprême qui réveille d'effroyables pirates...
S02E03 - Les ennuis n'arrivent jamais seuls
Lloyd et les ninjas se rendent à l'ancienne école de Lloyd où il est censé recevoir un prix. Mais ses anciens camarades l'ont dupé et emprisonnent le groupe.
S02E04 - La course ninjaball
Pour sauver le dojo de Sensei Darreth, les ninjas décident de participer à la course Ninjaball dont le premier prix est une forte somme d'argent.
S02E05 - Jeux d'enfants
Lord Garmadon utilise son arme suprême pour remonter dans le temps et ressusciter un grundal. Mais son arme a aussi rajeuni les ninjas. Ils sont trop petits pour vaincre le monstre.
S02E06 - Retour vers le passé
Dans le but de remonter le temps et d'empêcher Kai de devenir un ninja, Lord Garmadon n'a pas le choix : il doit se servir de son arme suprême.
S02E07 - Le guerrier de pierre
Les ninjas sont appelés au musée d'histoire où ils tombent sur le guerrier de pierre et la mère de Lloyd...
S02E08 - Le jour où Ninjago s'est mis à trembler
Sensei et les ninjas sont inquiets : un tremblement de terre secoue Ninjago City. Ce sont en fait les serpents qui ont l'intention de détruire la ville.
S02E09 - Retrouvailles
Les héros embarquent pour l'île des Ténèbres et échappent de peu à une attaque de Mâchoires de Mer. Zane retrouve son père vivant mais prisonnier d'un terrible Leviathan. Il s'avère très difficile d'organiser son évasion.
S02E10 - Le temple de la lumière
Les cinq ninjas s'en vont au temple de la lumière trouver ce que ce lieu leur réserve. Ils doivent affronter une armée de pierre.
S02E11 - Le dernier espoir
Misako pense avoir trouvé le moyen d'empêcher l'ultime combat : il faudrait dérober le casque à Garmadon et le rapporter à l'horloge fatale.
S02E12 - L'ultime combat a commencé
Lloyd va à nouveau devoir affronter son père. Mais Lord Garmadon s'est métamorphosé : il est possédé par l'Overlordet et ne fera preuve d'aucune pitié envers Lloyd...
S02E13 - L'avènement du maître du Spinjitzu
La bataille finale doit avoir lieu aujourd'hui mais Lloyd est blessé. L'équipe se rend au temple de la lumière où elle trouve l'armure d'or qui permet à Lloyd de quitter l'île. Une fois à Ninjago, il devient le maître du Spinjitzu suprême et combattre Overlord.