Deux vilains, le professeur Pyg et monsieur Crapaud, enlèvent des millionnaires, dont Alfred, qu'ils prennent pour Bruce Wayne. Batman se lance sur leurs traces.
S01E02 - Secrets
Une nouvelle criminelle arrive à Gotham : Magpie. Batman et le lieutenant Gordon, chacun de son côté, tentent de la mettre hors d'état de nuire.
S01E03 - Mise à l'épreuve
Alors qu'Anarky élabore un plan pour détruire Gotham, Batman poursuit la formation de Tatsu, qui va devenir une super-héroïne portant le nom de Katana.
S01E04 - Risque zéro
Pour soustraire le scientifique Jason Burr aux griffes de la Ligue des Assassins, Bruce le cache dans son manoir, sous la garde d'Alfred et Katana.
S01E05 - Fêlé
Des personnes errent dans Gotham, piégées dans des enveloppes qui les font ressembler à des soldats. Batman cherche à trouver le responsable.
S01E06 - Toxique
Un agent de sécurité, exposé à un gaz toxique, commence à muter et développe des super-pouvoirs. Batman tente de le retrouver pour le soigner.
S01E07 - Bienvenue dans la famille
Bruce Wayne est kidnappé par Silver Monkey, qui souhaite l'échanger contre l'épée légendaire Soultaker. Katana se porte au secours de son employeur.
S01E08 - Alliés
Tobias Whale, un criminel de Gotham City traqué par Gordon, kidnappe la fille du lieutenant. Ce dernier fait appel à Batman pour qu'il la libère.
S01E09 - Contrôle absolu
Pour accéder au Cortex ionique, Lady Shiva fait appel à Cypher, un androïde capable de manipuler les esprits. En l'affrontant, Katana est capturée.
S01E10 - Sacrifice
Anarky provoque la colère de la Ligue des Assassins et attire Batman dans un piège. Au cours du combat qui suit, une toxine mutagène est libérée.
S01E11 - Instinct
Batman et Katana se lancent à la poursuite du professeur Pyg et de monsieur Toad, qui s'en prennent au milieu de la haute couture de Gotham City.
S01E12 - Attirance
Batman rend visite à Magpie, espérant l'aider à retrouver la mémoire. Il y parvient quand Magpie aperçoit Katana, mais pas avec les résultats escomptés.
S01E13 - La Chute
Lady Shiva sort Ra's al Ghul de son animation suspendue. Désormais, la Ligue des Assassins au grand complet peut affronter Batman et ses alliés.
S01E14 - Ténèbres
Batman est contraint de s'associer à Silver Monkey pour échapper à la Ligue. Pendant ce temps, ses amis tentent de nettoyer les rues de Gotham.
S01E15 - Allégeance
Ra's al Ghul rassemble une armée de super-vilains pour affronter et vaincre Batman. Pendant ce temps, Gordon cherche à neutraliser le Cortex ionique.
S01E16 - Nectar
Six mois après la panne d'électricité, le nouveau Harvey Dent essaie de mettre fin à la vie de Batman. Il se retrouve piégé dans une attaque portant atteinte à la vie du maire Grange. Batman prend une mesure radicale pour découvrir qui est responsable.
S01E17 - Les monstres
Batman et Katana s'associent à Rex Mason, aussi connu sous le nom de «Golem de l'ancienne Gotham» pour qu'ils combattent une armée de voyous...
S01E18 - Jeu de piste
Humpty Dumpty capture Batman, Katana, Gordon, le maire Grange et Tobias Whale.
S01E19 - Animal
Pour suivre à la trace un voleur qui s'est emparé d'une pièce d'un dangereux logiciel, Batman se fait arrêter afin d'intégrer la prison Blackgate.
S01E20 - Manbat
Les premières années de Bruce Wayne sous le masque de Batman, super-héros engagé contre le crime organisé, secondé dans sa tâche d'une fine équipe de justiciers.
S01E21 - Unique
Les premières années de Bruce Wayne sous le masque de Batman, super-héros engagé contre le crime organisé, secondé dans sa tâche d'une fine équipe de justiciers.
S01E22 - Héros
Les premières années de Bruce Wayne sous le masque de Batman, super-héros engagé contre le crime organisé, secondé dans sa tâche d'une fine équipe de justiciers.
S01E23 - Choix
Quand Batman et Katana sont pris en embuscade dans le métro de Gotham par Killer Croc, il est du devoir de Barbara Gordon de les sauver. Mais cette dernière a un rendez-vous...
S01E24 - Epitaphe
Quand Bruce Wayne est «assassiné» par Batman, il se fait passer pour mort afin de commencer sa recherche sur le «faux Batman», un imposteur...
S01E25 - Coup tordu
Batman continue de travailler dans le secret afin de trouve des réponses à ses questions, tandis que Harvey Dent récupère à l'hôpital de Gotham. En accusant Batman de tout les maux, il promulgue la loi martiale dans Gotham...
S01E26 - Solitaire
Quand Alfred est pris en otage par Deathstroke à l'intérieur de la Batcave, Batman doit lui faire face seul. Harvey Dent révèle alors sa vraie nature...