Fred Caïn vient de recevoir les papiers de son divorce. Deux affaires l'empêchent toutefois de s'apitoyer sur son sort trop longtemps : l'inquiétante disparition d'une joggeuse et le suicide d'une femme. Au fil de son enquête sur le décès de cette dernière, le capitaine croise le chemin de personnages étonnants. Stefan, l'ex-compagnon de la défunte, affiche une indifférence troublante devant cette tragique nouvelle. Il ne songe qu'à sa nouvelle idylle avec Diane, une femme qui semble particulièrement attirée par les sujets morbides. Le bonheur écoeurant des deux tourtereaux, bientôt mariés, éveille un intérêt grandissant chez Caïn...
S02E02 - Ornella
Agressé sur un terrain de fouilles, un archéologue tombe dans le coma. Avant de sombrer, il murmure un prénom à l'oreille de Caïn : «Ornella». Cette mystérieuse confidence conduit le capitaine sur la piste d'un psychiatre, le docteur Pasteur, et de sa fragile épouse, Ornella. La jeune femme souffre d'étranges crises de somnambulisme...
S02E03 - Caïn et Abel
Un jeune femme affreusement mutilée gît sur l'autel d'une petite chapelle. Le meurtre, fort en symboles, ressemble étrangement aux crimes commis par Emmanuel Pasquet, un tueur en série démoniaque, aussi appelé «l'Inquisiteur». Le meurtrier a-t-il frappé de nouveau ? Fred Caïn, perplexe, sent pourtant que cette scène sanglante est l'oeuvre d'un copycat. Et pas n'importe lequel : le mari de la victime, également l'un de ses vieux amis, soutien infaillible lorsqu'il avait perdu ses jambes. Le capitaine doit-il faire confiance à celui qui l'a aidé pendant ses longues et douloureuses semaines de réeducation ? L'affaire prend vite une tournure personnelle...
S02E04 - Caïn et Abel
Fred Caïn, qui soupçonne l'un de ses vieux amis d'avoir assassiné son épouse, se retrouve impliqué personnellement dans une affaire sordide. Le capitaine risque aussi de perdre ce qui lui tient le plus à coeur : l'amour de sa vie, Gaëlle...
S02E05 - L'île
Se déplacer en fauteuil roulant n'empêche pas le capitaine Fred Caïn de virevolter autour des suspects et d'être toujours là où on ne l'attend pas. L'homme use sans honte de son handicap pour outrepasser les convenances. Le cadavre d'une femme a été découvert sur les rochers de l'île du Frioul. Le corps de la victime est mutilé, nu. Un noeud papillon encercle le cou en guise de signature : il était l'emblème de Golden Jane, star du porno des années 90. Revenue vivre sur l'île de son enfance, l'ancienne vedette est rejetée par sa famille et montrée du doigt par ces habitants. Mais il lui reste au moins deux fans : Caïn et l'assassin...
S02E06 - Mauvais garçon
Lors d'une traque dans le port autonome de Marseille, Lucie abat un suspect de sang-froid. Quelques jours plus tôt, un meurtre a été commis, fruit d'un règlement de comptes dans le milieu du proxénétisme, qui a également donné lieu à l'arrestation d'un suspect, un dénommé Wolf. L'homme est en réalité un policier infiltré, qui entraîne Lucie sur une pente dangereuse...
S02E07 - Duels
Un chirurgien vient d'être retrouvé assassiné. Au cours de l'enquête, Caïn se retrouve face à face avec le neurologue qui lui a «sauvé la vie» six ans plus tôt, le laissant tout de même amputé. Les retrouvailles sont loin d'être chaleureuses. Un duel s'engage presque aussitôt entre les deux hommes. Est-ce parce que le flic en fauteuil roulant en veut à son sauveur ou parce qu'il sent la mort rôder dans cette clinique, qui expérimente un nouveau traitement sur des cobayes humains ? Parallèlement, Caïn se plaint de douleurs chroniques et de plus en plus insupportables à la base de sa colonne vertébrale...
S02E08 - Dieu, Caïn, etc...
Caïn se rend avec Lucie au couvent de l'Annonciation pour les besoins d'une nouvelle enquête. Une soeur, soumise comme les autres religieuses à des méthodes de management abusives, se serait suicidée. Une jeune femme est prête à témoigner contre la mère supérieure, manipulatrice. Mais Caïn sent qu'elle cache un secret bien plus complexe et insidieux qui tourmente ces âmes pieuses...