Connor, un hacker de génie, découvre Cicada 3301, une mystérieuse chasse au trésor en ligne menée par une organisation secrète. Épaulé par un expert en art et une bibliothécaire, Connor se précipite dans une quête d’indices dans le monde réel pour mettre la main sur le trésor.Mais ils n’est pas seul : de dangereux agents de la NSA, également sur la piste de Cicada, se lancent à la poursuite de Connor.
Une jeune femme retourne vivre dans les Hamptons où elle a passé une partie de son enfance. Sous le pseudonyme d'Emily Thorne, elle a la ferme intention de détruire ceux qui ont brisé son innocence et gâché la vie de son père. Elle est prête à tout pour le venger...