Cheik Doukouré part de sa Guinée natale en 1964 pour Paris. Il rentre au Cours Simon en 1965 puis à la rue Blanche. Tout en menant une carrière de comédien au théâtre et à la télévision, il fait régulièrement des apparitions au cinéma (Les Ripoux, 1986 ; Un indien dans la ville, 1994).
A la fin des années 70 il commence à écrire des scénarios (Bako, l'autre rive, 1978; Black Mic Mac, 1986) et finit par passer à la réalisation en 1991 avec Blanc d'ebene qui se déroule en Guinée pendant la Seconde Guerre mondiale. Il fonde en 1993 sa maison de production en Guinée : Bako Productions grâce à laquelle il peut financer son deuxième long Le Ballon d'or sur un paysan africain qui devient une star du foot.
En 2001, il crée en France Les Films de l'Alliance en association avec sa scénariste Danielle Ryan pour produire Paris selon Moussa qui aborde le sujet des sans-papiers africains.